Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GABRA4P48169 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABRA4P48169 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABRA4P48169 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRA4P48169 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRA4P48169 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABRA4P48169 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABRA4P48169 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GABRA4P48169 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GABRA4P48169 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABRA4P48169 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABRA4P48169 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABRA4P48169 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABRA4P48169 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GABRA4P48169 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GABRA4P48169 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABRA4P48169 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GABRA4P48169 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRA4P48169 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRA4P48169 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRA4P48169 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRA4P48169 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRA4P48169 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABRA4P48169 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABRA4P48169 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GABRA4P48169 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GABRA4P48169 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABRA4P48169 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABRA4P48169 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABRA4P48169 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABRA4P48169 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABRA4P48169 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABRA4P48169 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GABRA4P48169 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GABRA4P48169 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABRA4P48169 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GABRA4P48169 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABRA4P48169 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GABRA4P48169 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GABRA4P48169 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GABRA4P48169 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABRA4P48169 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABRA4P48169 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABRA4P48169 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABRA4P48169 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABRA4P48169 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABRA4P48169 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GABRA4P48169 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABRA4P48169 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABRA4P48169 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABRA4P48169 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABRA4P48169 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABRA4P48169 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABRA4P48169 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABRA4P48169 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABRA4P48169 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABRA4P48169 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABRA4P48169 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GABRA4P48169 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
GABRA4P48169 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GABRA4P48169 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABRA4P48169 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABRA4P48169 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABRA4P48169 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRA4P48169 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRA4P48169 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRA4P48169 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABRA4P48169 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABRA4P48169 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABRA4P48169 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABRA4P48169 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABRA4P48169 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABRA4P48169 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GABRA4P48169 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GABRA4P48169 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABRA4P48169 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABRA4P48169 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABRA4P48169 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABRA4P48169 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABRA4P48169 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABRA4P48169 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABRA4P48169 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABRA4P48169 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABRA4P48169 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABRA4P48169 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABRA4P48169 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABRA4P48169 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABRA4P48169 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABRA4P48169 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABRA4P48169 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABRA4P48169 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABRA4P48169 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRA4P48169 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRA4P48169 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRA4P48169 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRA4P48169 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABRA4P48169 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABRA4P48169 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABRA4P48169 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABRA4P48169 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms