Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RGRP47804 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGRP47804 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGRP47804 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RGRP47804 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGRP47804 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGRP47804 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RGRP47804 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGRP47804 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
RGRP47804 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGRP47804 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
RGRP47804 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGRP47804 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGRP47804 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGRP47804 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RGRP47804 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGRP47804 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGRP47804 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGRP47804 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RGRP47804 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RGRP47804 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGRP47804 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGRP47804 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGRP47804 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGRP47804 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGRP47804 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGRP47804 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGRP47804 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGRP47804 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGRP47804 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGRP47804 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGRP47804 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGRP47804 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGRP47804 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGRP47804 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGRP47804 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGRP47804 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGRP47804 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGRP47804 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGRP47804 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGRP47804 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGRP47804 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGRP47804 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGRP47804 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGRP47804 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGRP47804 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGRP47804 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGRP47804 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGRP47804 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGRP47804 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGRP47804 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGRP47804 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGRP47804 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGRP47804 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGRP47804 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGRP47804 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGRP47804 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGRP47804 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RGRP47804 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGRP47804 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGRP47804 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGRP47804 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGRP47804 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGRP47804 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGRP47804 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGRP47804 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGRP47804 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGRP47804 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGRP47804 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RGRP47804 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGRP47804 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGRP47804 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGRP47804 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGRP47804 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RGRP47804 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGRP47804 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGRP47804 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGRP47804 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGRP47804 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGRP47804 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGRP47804 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGRP47804 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGRP47804 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGRP47804 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGRP47804 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGRP47804 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGRP47804 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGRP47804 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGRP47804 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGRP47804 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGRP47804 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGRP47804 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGRP47804 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGRP47804 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGRP47804 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGRP47804 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGRP47804 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGRP47804 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGRP47804 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGRP47804 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms