Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKN1BP46527 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKN1BP46527 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKN1BP46527 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKN1BP46527 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKN1BP46527 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDKN1BP46527 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDKN1BP46527 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDKN1BP46527 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDKN1BP46527 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDKN1BP46527 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDKN1BP46527 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDKN1BP46527 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDKN1BP46527 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDKN1BP46527 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDKN1BP46527 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKN1BP46527 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKN1BP46527 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKN1BP46527 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN1BP46527 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN1BP46527 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN1BP46527 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN1BP46527 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN1BP46527 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKN1BP46527 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN1BP46527 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN1BP46527 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN1BP46527 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN1BP46527 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN1BP46527 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKN1BP46527 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN1BP46527 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN1BP46527 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN1BP46527 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN1BP46527 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN1BP46527 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN1BP46527 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN1BP46527 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN1BP46527 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKN1BP46527 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKN1BP46527 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKN1BP46527 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKN1BP46527 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKN1BP46527 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKN1BP46527 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKN1BP46527 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKN1BP46527 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKN1BP46527 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKN1BP46527 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKN1BP46527 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKN1BP46527 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKN1BP46527 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKN1BP46527 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKN1BP46527 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKN1BP46527 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKN1BP46527 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKN1BP46527 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKN1BP46527 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKN1BP46527 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKN1BP46527 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKN1BP46527 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKN1BP46527 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKN1BP46527 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN1BP46527 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN1BP46527 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN1BP46527 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN1BP46527 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDKN1BP46527 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDKN1BP46527 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN1BP46527 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN1BP46527 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN1BP46527 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN1BP46527 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN1BP46527 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN1BP46527 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN1BP46527 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN1BP46527 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN1BP46527 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN1BP46527 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN1BP46527 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN1BP46527 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN1BP46527 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN1BP46527 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN1BP46527 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKN1BP46527 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN1BP46527 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN1BP46527 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN1BP46527 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN1BP46527 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN1BP46527 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN1BP46527 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN1BP46527 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDKN1BP46527 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDKN1BP46527 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDKN1BP46527 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN1BP46527 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN1BP46527 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN1BP46527 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN1BP46527 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN1BP46527 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms