Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC44.18■■■■■ 4.66
RANGAP1P46060 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC44.17■■■■■ 4.66
RANGAP1P46060 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
RANGAP1P46060 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
RANGAP1P46060 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
RANGAP1P46060 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
RANGAP1P46060 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
RANGAP1P46060 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
RANGAP1P46060 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
RANGAP1P46060 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
RANGAP1P46060 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
RANGAP1P46060 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
RANGAP1P46060 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
RANGAP1P46060 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
RANGAP1P46060 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
RANGAP1P46060 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
RANGAP1P46060 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
RANGAP1P46060 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC44.02■■■■■ 4.64
RANGAP1P46060 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
RANGAP1P46060 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
RANGAP1P46060 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
RANGAP1P46060 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
RANGAP1P46060 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC43.94■■■■■ 4.62
RANGAP1P46060 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC43.93■■■■■ 4.62
RANGAP1P46060 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
RANGAP1P46060 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
RANGAP1P46060 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
RANGAP1P46060 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
RANGAP1P46060 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
RANGAP1P46060 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC43.9■■■■■ 4.62
RANGAP1P46060 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
RANGAP1P46060 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
RANGAP1P46060 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.62
RANGAP1P46060 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC43.87■■■■■ 4.61
RANGAP1P46060 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
RANGAP1P46060 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
RANGAP1P46060 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
RANGAP1P46060 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
RANGAP1P46060 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
RANGAP1P46060 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
RANGAP1P46060 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
RANGAP1P46060 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.6
RANGAP1P46060 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
RANGAP1P46060 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.81■■■■■ 4.6
RANGAP1P46060 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
RANGAP1P46060 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
RANGAP1P46060 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
RANGAP1P46060 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
RANGAP1P46060 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC43.76■■■■■ 4.6
RANGAP1P46060 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
RANGAP1P46060 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
RANGAP1P46060 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
RANGAP1P46060 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
RANGAP1P46060 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
RANGAP1P46060 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
RANGAP1P46060 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
RANGAP1P46060 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC43.72■■■■■ 4.59
RANGAP1P46060 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
RANGAP1P46060 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.7■■■■■ 4.59
RANGAP1P46060 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
RANGAP1P46060 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.7■■■■■ 4.59
RANGAP1P46060 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
RANGAP1P46060 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
RANGAP1P46060 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
RANGAP1P46060 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC43.68■■■■■ 4.58
RANGAP1P46060 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
RANGAP1P46060 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
RANGAP1P46060 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
RANGAP1P46060 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
RANGAP1P46060 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
RANGAP1P46060 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC43.62■■■■■ 4.57
RANGAP1P46060 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC43.62■■■■■ 4.57
RANGAP1P46060 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC43.62■■■■■ 4.57
RANGAP1P46060 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
RANGAP1P46060 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
RANGAP1P46060 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC43.59■■■■■ 4.57
RANGAP1P46060 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
RANGAP1P46060 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
RANGAP1P46060 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC43.55■■■■■ 4.56
RANGAP1P46060 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC43.55■■■■■ 4.56
RANGAP1P46060 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
RANGAP1P46060 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
RANGAP1P46060 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
RANGAP1P46060 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
RANGAP1P46060 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
RANGAP1P46060 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC43.5■■■■■ 4.55
RANGAP1P46060 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
RANGAP1P46060 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
RANGAP1P46060 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
RANGAP1P46060 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
RANGAP1P46060 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
RANGAP1P46060 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
RANGAP1P46060 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
RANGAP1P46060 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
RANGAP1P46060 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
RANGAP1P46060 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
RANGAP1P46060 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
RANGAP1P46060 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
RANGAP1P46060 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
RANGAP1P46060 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms