Protein–RNA interactions for Protein: P42773

CDKN2C, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2CP42773 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKN2CP42773 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKN2CP42773 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKN2CP42773 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKN2CP42773 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKN2CP42773 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKN2CP42773 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKN2CP42773 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKN2CP42773 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKN2CP42773 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKN2CP42773 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKN2CP42773 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDKN2CP42773 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDKN2CP42773 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDKN2CP42773 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDKN2CP42773 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKN2CP42773 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKN2CP42773 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKN2CP42773 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKN2CP42773 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKN2CP42773 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKN2CP42773 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKN2CP42773 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDKN2CP42773 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKN2CP42773 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKN2CP42773 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKN2CP42773 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKN2CP42773 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKN2CP42773 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKN2CP42773 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDKN2CP42773 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKN2CP42773 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKN2CP42773 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKN2CP42773 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKN2CP42773 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKN2CP42773 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKN2CP42773 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKN2CP42773 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKN2CP42773 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKN2CP42773 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKN2CP42773 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKN2CP42773 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKN2CP42773 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKN2CP42773 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKN2CP42773 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKN2CP42773 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKN2CP42773 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKN2CP42773 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKN2CP42773 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKN2CP42773 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKN2CP42773 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKN2CP42773 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKN2CP42773 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKN2CP42773 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKN2CP42773 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKN2CP42773 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKN2CP42773 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKN2CP42773 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKN2CP42773 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKN2CP42773 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKN2CP42773 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2CP42773 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2CP42773 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKN2CP42773 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKN2CP42773 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKN2CP42773 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKN2CP42773 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKN2CP42773 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2CP42773 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2CP42773 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2CP42773 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2CP42773 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2CP42773 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2CP42773 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKN2CP42773 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKN2CP42773 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKN2CP42773 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKN2CP42773 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKN2CP42773 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKN2CP42773 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKN2CP42773 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKN2CP42773 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN2CP42773 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN2CP42773 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN2CP42773 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKN2CP42773 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKN2CP42773 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKN2CP42773 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKN2CP42773 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKN2CP42773 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN2CP42773 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN2CP42773 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN2CP42773 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN2CP42773 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN2CP42773 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN2CP42773 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN2CP42773 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKN2CP42773 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKN2CP42773 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKN2CP42773 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms