Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP3P42574 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP3P42574 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP3P42574 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP3P42574 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP3P42574 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP3P42574 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP3P42574 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP3P42574 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP3P42574 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP3P42574 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP3P42574 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP3P42574 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP3P42574 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP3P42574 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP3P42574 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP3P42574 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASP3P42574 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP3P42574 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP3P42574 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP3P42574 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP3P42574 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP3P42574 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP3P42574 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP3P42574 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP3P42574 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP3P42574 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP3P42574 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP3P42574 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP3P42574 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP3P42574 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP3P42574 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP3P42574 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP3P42574 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP3P42574 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP3P42574 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP3P42574 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP3P42574 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP3P42574 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP3P42574 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP3P42574 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP3P42574 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP3P42574 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP3P42574 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP3P42574 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP3P42574 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP3P42574 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP3P42574 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP3P42574 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP3P42574 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP3P42574 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP3P42574 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP3P42574 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP3P42574 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP3P42574 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP3P42574 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP3P42574 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP3P42574 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP3P42574 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP3P42574 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP3P42574 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP3P42574 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP3P42574 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP3P42574 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP3P42574 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP3P42574 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP3P42574 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP3P42574 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP3P42574 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CASP3P42574 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP3P42574 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP3P42574 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP3P42574 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP3P42574 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP3P42574 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP3P42574 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP3P42574 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP3P42574 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP3P42574 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP3P42574 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP3P42574 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP3P42574 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP3P42574 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP3P42574 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP3P42574 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP3P42574 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP3P42574 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP3P42574 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP3P42574 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP3P42574 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP3P42574 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP3P42574 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP3P42574 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP3P42574 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP3P42574 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP3P42574 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP3P42574 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP3P42574 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP3P42574 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP3P42574 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms