Protein–RNA interactions for Protein: P42357

HAL, Histidine ammonia-lyase, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HALP42357 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HALP42357 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HALP42357 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HALP42357 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HALP42357 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HALP42357 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HALP42357 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HALP42357 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HALP42357 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HALP42357 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HALP42357 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HALP42357 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HALP42357 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HALP42357 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HALP42357 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HALP42357 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HALP42357 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HALP42357 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HALP42357 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HALP42357 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HALP42357 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HALP42357 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HALP42357 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HALP42357 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HALP42357 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HALP42357 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HALP42357 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HALP42357 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HALP42357 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HALP42357 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HALP42357 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HALP42357 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HALP42357 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HALP42357 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HALP42357 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HALP42357 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HALP42357 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HALP42357 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HALP42357 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HALP42357 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HALP42357 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HALP42357 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HALP42357 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HALP42357 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HALP42357 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HALP42357 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HALP42357 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HALP42357 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HALP42357 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HALP42357 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HALP42357 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HALP42357 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HALP42357 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HALP42357 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HALP42357 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HALP42357 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HALP42357 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HALP42357 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HALP42357 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HALP42357 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HALP42357 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HALP42357 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HALP42357 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HALP42357 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HALP42357 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HALP42357 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HALP42357 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HALP42357 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HALP42357 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HALP42357 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HALP42357 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HALP42357 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HALP42357 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HALP42357 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HALP42357 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HALP42357 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HALP42357 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HALP42357 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HALP42357 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HALP42357 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HALP42357 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HALP42357 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HALP42357 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HALP42357 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HALP42357 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HALP42357 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HALP42357 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HALP42357 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HALP42357 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HALP42357 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HALP42357 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HALP42357 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HALP42357 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HALP42357 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HALP42357 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HALP42357 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HALP42357 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HALP42357 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HALP42357 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HALP42357 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms