Protein–RNA interactions for Protein: P36980

CFHR2, Complement factor H-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR2P36980 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFHR2P36980 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CFHR2P36980 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFHR2P36980 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFHR2P36980 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CFHR2P36980 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFHR2P36980 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFHR2P36980 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFHR2P36980 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFHR2P36980 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFHR2P36980 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFHR2P36980 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CFHR2P36980 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFHR2P36980 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFHR2P36980 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFHR2P36980 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFHR2P36980 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFHR2P36980 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHR2P36980 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHR2P36980 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHR2P36980 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFHR2P36980 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFHR2P36980 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFHR2P36980 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFHR2P36980 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFHR2P36980 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFHR2P36980 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFHR2P36980 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFHR2P36980 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFHR2P36980 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFHR2P36980 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFHR2P36980 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFHR2P36980 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFHR2P36980 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFHR2P36980 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFHR2P36980 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFHR2P36980 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFHR2P36980 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CFHR2P36980 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFHR2P36980 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFHR2P36980 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFHR2P36980 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFHR2P36980 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFHR2P36980 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFHR2P36980 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFHR2P36980 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFHR2P36980 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFHR2P36980 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFHR2P36980 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFHR2P36980 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFHR2P36980 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFHR2P36980 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFHR2P36980 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFHR2P36980 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CFHR2P36980 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFHR2P36980 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFHR2P36980 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFHR2P36980 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFHR2P36980 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFHR2P36980 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFHR2P36980 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFHR2P36980 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFHR2P36980 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFHR2P36980 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFHR2P36980 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFHR2P36980 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFHR2P36980 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFHR2P36980 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFHR2P36980 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFHR2P36980 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFHR2P36980 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFHR2P36980 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFHR2P36980 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFHR2P36980 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 578.4 ms