Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARL3P36405 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARL3P36405 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARL3P36405 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARL3P36405 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARL3P36405 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARL3P36405 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARL3P36405 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARL3P36405 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARL3P36405 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARL3P36405 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARL3P36405 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARL3P36405 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARL3P36405 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARL3P36405 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL3P36405 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL3P36405 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL3P36405 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARL3P36405 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARL3P36405 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ARL3P36405 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARL3P36405 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARL3P36405 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARL3P36405 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARL3P36405 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ARL3P36405 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARL3P36405 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARL3P36405 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARL3P36405 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARL3P36405 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARL3P36405 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ARL3P36405 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARL3P36405 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARL3P36405 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARL3P36405 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARL3P36405 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARL3P36405 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARL3P36405 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARL3P36405 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARL3P36405 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARL3P36405 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARL3P36405 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARL3P36405 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARL3P36405 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARL3P36405 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL3P36405 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL3P36405 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARL3P36405 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARL3P36405 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARL3P36405 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARL3P36405 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARL3P36405 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARL3P36405 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARL3P36405 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARL3P36405 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARL3P36405 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARL3P36405 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARL3P36405 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARL3P36405 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ARL3P36405 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARL3P36405 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARL3P36405 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARL3P36405 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARL3P36405 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ARL3P36405 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARL3P36405 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARL3P36405 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARL3P36405 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARL3P36405 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL3P36405 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARL3P36405 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARL3P36405 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARL3P36405 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARL3P36405 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARL3P36405 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARL3P36405 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARL3P36405 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARL3P36405 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARL3P36405 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARL3P36405 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARL3P36405 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARL3P36405 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARL3P36405 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARL3P36405 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARL3P36405 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARL3P36405 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARL3P36405 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARL3P36405 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARL3P36405 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL3P36405 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL3P36405 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL3P36405 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL3P36405 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL3P36405 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARL3P36405 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ARL3P36405 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL3P36405 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL3P36405 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL3P36405 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL3P36405 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms