Protein–RNA interactions for Protein: P35900

KRT20, Keratin, type I cytoskeletal 20, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20P35900 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT20P35900 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT20P35900 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT20P35900 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
KRT20P35900 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT20P35900 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT20P35900 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT20P35900 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT20P35900 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT20P35900 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT20P35900 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT20P35900 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT20P35900 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT20P35900 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT20P35900 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT20P35900 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT20P35900 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT20P35900 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT20P35900 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT20P35900 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT20P35900 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT20P35900 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT20P35900 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT20P35900 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT20P35900 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT20P35900 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT20P35900 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT20P35900 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT20P35900 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT20P35900 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT20P35900 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT20P35900 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT20P35900 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT20P35900 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT20P35900 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT20P35900 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT20P35900 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT20P35900 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT20P35900 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT20P35900 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT20P35900 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT20P35900 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT20P35900 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT20P35900 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT20P35900 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT20P35900 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT20P35900 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT20P35900 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT20P35900 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT20P35900 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT20P35900 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT20P35900 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT20P35900 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT20P35900 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT20P35900 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT20P35900 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT20P35900 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT20P35900 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT20P35900 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT20P35900 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT20P35900 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT20P35900 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT20P35900 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT20P35900 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT20P35900 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT20P35900 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT20P35900 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT20P35900 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT20P35900 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT20P35900 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT20P35900 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT20P35900 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT20P35900 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT20P35900 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT20P35900 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT20P35900 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT20P35900 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT20P35900 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT20P35900 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT20P35900 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT20P35900 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT20P35900 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT20P35900 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT20P35900 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT20P35900 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT20P35900 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT20P35900 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT20P35900 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT20P35900 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT20P35900 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT20P35900 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT20P35900 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT20P35900 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT20P35900 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT20P35900 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT20P35900 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT20P35900 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT20P35900 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT20P35900 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT20P35900 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.5 ms