Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SOX11P35716 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SOX11P35716 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOX11P35716 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOX11P35716 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOX11P35716 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOX11P35716 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SOX11P35716 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOX11P35716 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOX11P35716 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SOX11P35716 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SOX11P35716 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX11P35716 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX11P35716 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX11P35716 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX11P35716 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX11P35716 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX11P35716 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX11P35716 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX11P35716 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX11P35716 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX11P35716 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX11P35716 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX11P35716 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX11P35716 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX11P35716 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX11P35716 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX11P35716 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX11P35716 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX11P35716 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX11P35716 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX11P35716 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOX11P35716 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOX11P35716 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOX11P35716 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOX11P35716 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX11P35716 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX11P35716 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOX11P35716 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOX11P35716 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOX11P35716 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOX11P35716 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX11P35716 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX11P35716 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX11P35716 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOX11P35716 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOX11P35716 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOX11P35716 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX11P35716 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX11P35716 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SOX11P35716 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX11P35716 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX11P35716 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX11P35716 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX11P35716 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOX11P35716 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOX11P35716 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOX11P35716 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SOX11P35716 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOX11P35716 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SOX11P35716 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOX11P35716 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOX11P35716 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOX11P35716 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOX11P35716 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX11P35716 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX11P35716 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX11P35716 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOX11P35716 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOX11P35716 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOX11P35716 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOX11P35716 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOX11P35716 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOX11P35716 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOX11P35716 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX11P35716 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX11P35716 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX11P35716 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX11P35716 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX11P35716 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX11P35716 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SOX11P35716 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX11P35716 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX11P35716 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX11P35716 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX11P35716 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX11P35716 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX11P35716 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX11P35716 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX11P35716 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX11P35716 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX11P35716 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX11P35716 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX11P35716 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX11P35716 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX11P35716 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX11P35716 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX11P35716 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX11P35716 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX11P35716 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms