Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFTPDP35247 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFTPDP35247 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFTPDP35247 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFTPDP35247 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFTPDP35247 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFTPDP35247 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFTPDP35247 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFTPDP35247 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFTPDP35247 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFTPDP35247 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFTPDP35247 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SFTPDP35247 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SFTPDP35247 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SFTPDP35247 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFTPDP35247 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFTPDP35247 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFTPDP35247 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFTPDP35247 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFTPDP35247 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFTPDP35247 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFTPDP35247 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFTPDP35247 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFTPDP35247 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFTPDP35247 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFTPDP35247 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFTPDP35247 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFTPDP35247 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFTPDP35247 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFTPDP35247 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFTPDP35247 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFTPDP35247 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SFTPDP35247 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFTPDP35247 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFTPDP35247 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFTPDP35247 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFTPDP35247 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFTPDP35247 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFTPDP35247 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFTPDP35247 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFTPDP35247 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFTPDP35247 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFTPDP35247 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFTPDP35247 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFTPDP35247 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFTPDP35247 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFTPDP35247 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFTPDP35247 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFTPDP35247 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFTPDP35247 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFTPDP35247 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFTPDP35247 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPDP35247 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPDP35247 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPDP35247 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFTPDP35247 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFTPDP35247 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFTPDP35247 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFTPDP35247 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SFTPDP35247 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFTPDP35247 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPDP35247 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPDP35247 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPDP35247 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SFTPDP35247 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFTPDP35247 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFTPDP35247 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFTPDP35247 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFTPDP35247 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFTPDP35247 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFTPDP35247 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFTPDP35247 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFTPDP35247 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFTPDP35247 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFTPDP35247 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFTPDP35247 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFTPDP35247 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFTPDP35247 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFTPDP35247 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFTPDP35247 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFTPDP35247 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFTPDP35247 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFTPDP35247 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SFTPDP35247 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFTPDP35247 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFTPDP35247 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFTPDP35247 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFTPDP35247 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SFTPDP35247 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFTPDP35247 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFTPDP35247 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFTPDP35247 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFTPDP35247 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFTPDP35247 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFTPDP35247 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SFTPDP35247 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFTPDP35247 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFTPDP35247 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFTPDP35247 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFTPDP35247 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms