Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJA4P35212 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJA4P35212 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA4P35212 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA4P35212 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA4P35212 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA4P35212 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA4P35212 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA4P35212 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA4P35212 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA4P35212 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJA4P35212 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJA4P35212 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJA4P35212 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJA4P35212 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJA4P35212 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJA4P35212 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJA4P35212 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJA4P35212 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJA4P35212 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJA4P35212 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJA4P35212 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJA4P35212 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJA4P35212 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJA4P35212 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJA4P35212 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJA4P35212 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJA4P35212 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJA4P35212 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJA4P35212 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJA4P35212 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJA4P35212 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJA4P35212 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJA4P35212 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJA4P35212 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJA4P35212 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJA4P35212 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJA4P35212 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJA4P35212 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJA4P35212 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJA4P35212 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJA4P35212 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJA4P35212 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJA4P35212 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJA4P35212 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJA4P35212 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJA4P35212 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJA4P35212 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJA4P35212 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJA4P35212 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJA4P35212 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJA4P35212 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJA4P35212 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJA4P35212 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJA4P35212 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJA4P35212 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJA4P35212 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GJA4P35212 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJA4P35212 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJA4P35212 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJA4P35212 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJA4P35212 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJA4P35212 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJA4P35212 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJA4P35212 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJA4P35212 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA4P35212 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA4P35212 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA4P35212 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA4P35212 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA4P35212 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJA4P35212 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJA4P35212 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJA4P35212 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GJA4P35212 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJA4P35212 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJA4P35212 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJA4P35212 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJA4P35212 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJA4P35212 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJA4P35212 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJA4P35212 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJA4P35212 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJA4P35212 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GJA4P35212 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJA4P35212 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJA4P35212 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJA4P35212 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJA4P35212 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJA4P35212 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJA4P35212 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJA4P35212 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJA4P35212 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJA4P35212 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GJA4P35212 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJA4P35212 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJA4P35212 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJA4P35212 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJA4P35212 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJA4P35212 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms