Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPC1P35052 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPC1P35052 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPC1P35052 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPC1P35052 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPC1P35052 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC1P35052 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC1P35052 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC1P35052 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC1P35052 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC1P35052 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC1P35052 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC1P35052 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC1P35052 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC1P35052 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GPC1P35052 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC1P35052 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC1P35052 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC1P35052 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC1P35052 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC1P35052 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC1P35052 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC1P35052 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC1P35052 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC1P35052 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC1P35052 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC1P35052 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC1P35052 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC1P35052 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPC1P35052 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPC1P35052 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPC1P35052 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GPC1P35052 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC1P35052 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC1P35052 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC1P35052 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPC1P35052 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPC1P35052 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC1P35052 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC1P35052 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPC1P35052 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC1P35052 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC1P35052 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC1P35052 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC1P35052 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC1P35052 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC1P35052 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC1P35052 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC1P35052 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC1P35052 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC1P35052 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC1P35052 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC1P35052 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GPC1P35052 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
GPC1P35052 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC1P35052 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC1P35052 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC1P35052 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC1P35052 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC1P35052 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC1P35052 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC1P35052 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC1P35052 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC1P35052 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC1P35052 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC1P35052 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC1P35052 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC1P35052 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC1P35052 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC1P35052 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC1P35052 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC1P35052 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC1P35052 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC1P35052 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC1P35052 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC1P35052 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC1P35052 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC1P35052 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC1P35052 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC1P35052 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC1P35052 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC1P35052 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC1P35052 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GPC1P35052 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC1P35052 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC1P35052 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC1P35052 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC1P35052 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC1P35052 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC1P35052 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPC1P35052 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPC1P35052 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPC1P35052 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC1P35052 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC1P35052 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC1P35052 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC1P35052 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC1P35052 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC1P35052 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC1P35052 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms