Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CHRNA5P30532 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CHRNA5P30532 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CHRNA5P30532 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CHRNA5P30532 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CHRNA5P30532 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CHRNA5P30532 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CHRNA5P30532 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CHRNA5P30532 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CHRNA5P30532 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CHRNA5P30532 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CHRNA5P30532 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CHRNA5P30532 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CHRNA5P30532 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CHRNA5P30532 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHRNA5P30532 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHRNA5P30532 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CHRNA5P30532 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CHRNA5P30532 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHRNA5P30532 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHRNA5P30532 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHRNA5P30532 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
CHRNA5P30532 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CHRNA5P30532 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHRNA5P30532 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHRNA5P30532 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHRNA5P30532 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHRNA5P30532 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHRNA5P30532 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHRNA5P30532 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHRNA5P30532 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CHRNA5P30532 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CHRNA5P30532 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHRNA5P30532 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHRNA5P30532 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHRNA5P30532 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CHRNA5P30532 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CHRNA5P30532 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CHRNA5P30532 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CHRNA5P30532 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CHRNA5P30532 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHRNA5P30532 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHRNA5P30532 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHRNA5P30532 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHRNA5P30532 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHRNA5P30532 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHRNA5P30532 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHRNA5P30532 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHRNA5P30532 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHRNA5P30532 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHRNA5P30532 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHRNA5P30532 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHRNA5P30532 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHRNA5P30532 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CHRNA5P30532 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHRNA5P30532 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHRNA5P30532 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHRNA5P30532 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHRNA5P30532 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CHRNA5P30532 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHRNA5P30532 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHRNA5P30532 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CHRNA5P30532 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CHRNA5P30532 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHRNA5P30532 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHRNA5P30532 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHRNA5P30532 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHRNA5P30532 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHRNA5P30532 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHRNA5P30532 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHRNA5P30532 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHRNA5P30532 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHRNA5P30532 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CHRNA5P30532 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CHRNA5P30532 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CHRNA5P30532 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CHRNA5P30532 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CHRNA5P30532 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CHRNA5P30532 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHRNA5P30532 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHRNA5P30532 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHRNA5P30532 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CHRNA5P30532 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHRNA5P30532 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHRNA5P30532 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CHRNA5P30532 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHRNA5P30532 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHRNA5P30532 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHRNA5P30532 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CHRNA5P30532 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CHRNA5P30532 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CHRNA5P30532 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHRNA5P30532 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHRNA5P30532 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHRNA5P30532 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHRNA5P30532 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHRNA5P30532 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHRNA5P30532 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CHRNA5P30532 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHRNA5P30532 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms