Protein–RNA interactions for Protein: P30154

PPP2R1B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R1BP30154 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP2R1BP30154 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP2R1BP30154 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP2R1BP30154 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP2R1BP30154 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP2R1BP30154 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP2R1BP30154 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP2R1BP30154 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP2R1BP30154 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP2R1BP30154 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP2R1BP30154 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP2R1BP30154 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP2R1BP30154 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP2R1BP30154 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP2R1BP30154 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP2R1BP30154 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP2R1BP30154 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP2R1BP30154 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP2R1BP30154 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP2R1BP30154 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP2R1BP30154 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP2R1BP30154 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP2R1BP30154 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP2R1BP30154 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP2R1BP30154 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP2R1BP30154 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP2R1BP30154 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP2R1BP30154 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP2R1BP30154 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP2R1BP30154 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP2R1BP30154 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP2R1BP30154 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP2R1BP30154 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP2R1BP30154 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP2R1BP30154 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP2R1BP30154 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP2R1BP30154 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP2R1BP30154 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP2R1BP30154 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP2R1BP30154 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PPP2R1BP30154 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPP2R1BP30154 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP2R1BP30154 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP2R1BP30154 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP2R1BP30154 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP2R1BP30154 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP2R1BP30154 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP2R1BP30154 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP2R1BP30154 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP2R1BP30154 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP2R1BP30154 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP2R1BP30154 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP2R1BP30154 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP2R1BP30154 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP2R1BP30154 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP2R1BP30154 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP2R1BP30154 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP2R1BP30154 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP2R1BP30154 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP2R1BP30154 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP2R1BP30154 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP2R1BP30154 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPP2R1BP30154 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP2R1BP30154 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP2R1BP30154 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP2R1BP30154 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP2R1BP30154 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP2R1BP30154 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP2R1BP30154 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP2R1BP30154 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP2R1BP30154 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP2R1BP30154 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP2R1BP30154 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP2R1BP30154 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP2R1BP30154 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP2R1BP30154 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP2R1BP30154 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP2R1BP30154 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP2R1BP30154 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP2R1BP30154 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP2R1BP30154 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP2R1BP30154 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP2R1BP30154 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPP2R1BP30154 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP2R1BP30154 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP2R1BP30154 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP2R1BP30154 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP2R1BP30154 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP2R1BP30154 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP2R1BP30154 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP2R1BP30154 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP2R1BP30154 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP2R1BP30154 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP2R1BP30154 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP2R1BP30154 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP2R1BP30154 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP2R1BP30154 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP2R1BP30154 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP2R1BP30154 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP2R1BP30154 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms