Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CNGA1P29973 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CNGA1P29973 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CNGA1P29973 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CNGA1P29973 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CNGA1P29973 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CNGA1P29973 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CNGA1P29973 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CNGA1P29973 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CNGA1P29973 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CNGA1P29973 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CNGA1P29973 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CNGA1P29973 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CNGA1P29973 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CNGA1P29973 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CNGA1P29973 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CNGA1P29973 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CNGA1P29973 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CNGA1P29973 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CNGA1P29973 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CNGA1P29973 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CNGA1P29973 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CNGA1P29973 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CNGA1P29973 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CNGA1P29973 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CNGA1P29973 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CNGA1P29973 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CNGA1P29973 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CNGA1P29973 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CNGA1P29973 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CNGA1P29973 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CNGA1P29973 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CNGA1P29973 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CNGA1P29973 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CNGA1P29973 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CNGA1P29973 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CNGA1P29973 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CNGA1P29973 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CNGA1P29973 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CNGA1P29973 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CNGA1P29973 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CNGA1P29973 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CNGA1P29973 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CNGA1P29973 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CNGA1P29973 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CNGA1P29973 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CNGA1P29973 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CNGA1P29973 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CNGA1P29973 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CNGA1P29973 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CNGA1P29973 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CNGA1P29973 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CNGA1P29973 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CNGA1P29973 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CNGA1P29973 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CNGA1P29973 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CNGA1P29973 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CNGA1P29973 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CNGA1P29973 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CNGA1P29973 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CNGA1P29973 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CNGA1P29973 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CNGA1P29973 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CNGA1P29973 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CNGA1P29973 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CNGA1P29973 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CNGA1P29973 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CNGA1P29973 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CNGA1P29973 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CNGA1P29973 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CNGA1P29973 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CNGA1P29973 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CNGA1P29973 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CNGA1P29973 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CNGA1P29973 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CNGA1P29973 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CNGA1P29973 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CNGA1P29973 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CNGA1P29973 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CNGA1P29973 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CNGA1P29973 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
CNGA1P29973 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CNGA1P29973 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CNGA1P29973 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CNGA1P29973 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CNGA1P29973 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CNGA1P29973 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CNGA1P29973 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CNGA1P29973 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CNGA1P29973 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CNGA1P29973 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
CNGA1P29973 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CNGA1P29973 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CNGA1P29973 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CNGA1P29973 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CNGA1P29973 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CNGA1P29973 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CNGA1P29973 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CNGA1P29973 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CNGA1P29973 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms