Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CHMLP26374 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CHMLP26374 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHMLP26374 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHMLP26374 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHMLP26374 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CHMLP26374 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CHMLP26374 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CHMLP26374 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CHMLP26374 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CHMLP26374 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHMLP26374 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHMLP26374 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHMLP26374 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CHMLP26374 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CHMLP26374 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CHMLP26374 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CHMLP26374 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CHMLP26374 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CHMLP26374 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CHMLP26374 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CHMLP26374 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CHMLP26374 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CHMLP26374 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
CHMLP26374 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CHMLP26374 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CHMLP26374 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CHMLP26374 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CHMLP26374 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CHMLP26374 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CHMLP26374 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CHMLP26374 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CHMLP26374 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CHMLP26374 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CHMLP26374 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CHMLP26374 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CHMLP26374 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHMLP26374 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHMLP26374 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CHMLP26374 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CHMLP26374 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHMLP26374 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
CHMLP26374 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
CHMLP26374 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CHMLP26374 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CHMLP26374 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CHMLP26374 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CHMLP26374 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHMLP26374 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHMLP26374 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHMLP26374 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CHMLP26374 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CHMLP26374 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CHMLP26374 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHMLP26374 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
CHMLP26374 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHMLP26374 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CHMLP26374 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CHMLP26374 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CHMLP26374 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CHMLP26374 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHMLP26374 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHMLP26374 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHMLP26374 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHMLP26374 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CHMLP26374 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CHMLP26374 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHMLP26374 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHMLP26374 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CHMLP26374 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CHMLP26374 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CHMLP26374 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHMLP26374 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHMLP26374 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHMLP26374 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHMLP26374 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHMLP26374 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHMLP26374 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHMLP26374 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHMLP26374 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHMLP26374 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHMLP26374 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHMLP26374 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHMLP26374 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHMLP26374 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHMLP26374 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHMLP26374 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHMLP26374 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHMLP26374 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHMLP26374 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHMLP26374 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHMLP26374 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
CHMLP26374 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHMLP26374 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHMLP26374 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHMLP26374 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHMLP26374 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
CHMLP26374 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHMLP26374 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHMLP26374 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms