Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMA1P25391 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMA1P25391 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMA1P25391 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMA1P25391 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMA1P25391 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMA1P25391 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMA1P25391 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMA1P25391 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMA1P25391 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMA1P25391 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LAMA1P25391 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMA1P25391 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMA1P25391 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMA1P25391 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMA1P25391 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMA1P25391 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMA1P25391 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMA1P25391 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMA1P25391 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMA1P25391 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMA1P25391 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMA1P25391 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMA1P25391 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMA1P25391 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMA1P25391 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMA1P25391 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMA1P25391 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMA1P25391 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMA1P25391 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMA1P25391 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMA1P25391 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LAMA1P25391 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMA1P25391 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMA1P25391 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMA1P25391 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMA1P25391 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMA1P25391 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMA1P25391 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMA1P25391 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMA1P25391 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMA1P25391 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMA1P25391 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMA1P25391 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMA1P25391 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMA1P25391 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LAMA1P25391 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LAMA1P25391 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMA1P25391 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMA1P25391 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMA1P25391 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMA1P25391 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMA1P25391 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMA1P25391 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMA1P25391 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMA1P25391 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMA1P25391 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMA1P25391 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMA1P25391 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LAMA1P25391 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LAMA1P25391 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMA1P25391 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMA1P25391 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMA1P25391 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMA1P25391 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA1P25391 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA1P25391 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA1P25391 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA1P25391 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA1P25391 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMA1P25391 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMA1P25391 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMA1P25391 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMA1P25391 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMA1P25391 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMA1P25391 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMA1P25391 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMA1P25391 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMA1P25391 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA1P25391 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA1P25391 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA1P25391 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA1P25391 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMA1P25391 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMA1P25391 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMA1P25391 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMA1P25391 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMA1P25391 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMA1P25391 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMA1P25391 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMA1P25391 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMA1P25391 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMA1P25391 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMA1P25391 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMA1P25391 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMA1P25391 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMA1P25391 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMA1P25391 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMA1P25391 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMA1P25391 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 388.4 ms