Protein–RNA interactions for Protein: P23946

CMA1, Chymase, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMA1P23946 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CMA1P23946 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CMA1P23946 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CMA1P23946 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CMA1P23946 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CMA1P23946 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CMA1P23946 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CMA1P23946 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CMA1P23946 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CMA1P23946 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CMA1P23946 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CMA1P23946 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CMA1P23946 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CMA1P23946 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CMA1P23946 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CMA1P23946 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CMA1P23946 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CMA1P23946 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CMA1P23946 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CMA1P23946 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CMA1P23946 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CMA1P23946 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CMA1P23946 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CMA1P23946 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CMA1P23946 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CMA1P23946 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CMA1P23946 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CMA1P23946 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CMA1P23946 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CMA1P23946 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CMA1P23946 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CMA1P23946 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CMA1P23946 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CMA1P23946 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CMA1P23946 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CMA1P23946 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CMA1P23946 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CMA1P23946 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CMA1P23946 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CMA1P23946 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CMA1P23946 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CMA1P23946 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CMA1P23946 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CMA1P23946 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CMA1P23946 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CMA1P23946 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CMA1P23946 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CMA1P23946 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CMA1P23946 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CMA1P23946 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CMA1P23946 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CMA1P23946 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CMA1P23946 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CMA1P23946 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CMA1P23946 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CMA1P23946 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CMA1P23946 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CMA1P23946 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CMA1P23946 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CMA1P23946 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CMA1P23946 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CMA1P23946 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CMA1P23946 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CMA1P23946 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CMA1P23946 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CMA1P23946 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CMA1P23946 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CMA1P23946 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CMA1P23946 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CMA1P23946 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CMA1P23946 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CMA1P23946 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CMA1P23946 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CMA1P23946 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CMA1P23946 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CMA1P23946 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CMA1P23946 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CMA1P23946 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CMA1P23946 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CMA1P23946 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CMA1P23946 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CMA1P23946 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CMA1P23946 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CMA1P23946 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CMA1P23946 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CMA1P23946 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CMA1P23946 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CMA1P23946 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CMA1P23946 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CMA1P23946 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CMA1P23946 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CMA1P23946 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CMA1P23946 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CMA1P23946 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CMA1P23946 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CMA1P23946 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CMA1P23946 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CMA1P23946 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CMA1P23946 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CMA1P23946 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms