Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRDP23468 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRDP23468 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRDP23468 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRDP23468 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRDP23468 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRDP23468 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRDP23468 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRDP23468 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRDP23468 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRDP23468 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRDP23468 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRDP23468 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRDP23468 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRDP23468 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRDP23468 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRDP23468 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRDP23468 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRDP23468 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRDP23468 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRDP23468 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRDP23468 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRDP23468 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRDP23468 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRDP23468 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRDP23468 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRDP23468 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRDP23468 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRDP23468 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRDP23468 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRDP23468 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRDP23468 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRDP23468 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRDP23468 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRDP23468 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRDP23468 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRDP23468 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRDP23468 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRDP23468 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRDP23468 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRDP23468 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRDP23468 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRDP23468 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRDP23468 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRDP23468 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRDP23468 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRDP23468 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRDP23468 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRDP23468 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PTPRDP23468 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PTPRDP23468 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRDP23468 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRDP23468 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRDP23468 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRDP23468 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRDP23468 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRDP23468 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRDP23468 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRDP23468 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRDP23468 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRDP23468 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRDP23468 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRDP23468 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRDP23468 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRDP23468 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRDP23468 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRDP23468 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRDP23468 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRDP23468 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRDP23468 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRDP23468 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRDP23468 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRDP23468 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRDP23468 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRDP23468 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRDP23468 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRDP23468 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRDP23468 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRDP23468 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRDP23468 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRDP23468 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRDP23468 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRDP23468 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRDP23468 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRDP23468 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRDP23468 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRDP23468 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRDP23468 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRDP23468 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRDP23468 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRDP23468 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRDP23468 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRDP23468 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRDP23468 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRDP23468 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRDP23468 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRDP23468 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRDP23468 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRDP23468 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRDP23468 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
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