Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RPS6KB1P23443 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RPS6KB1P23443 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RPS6KB1P23443 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RPS6KB1P23443 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RPS6KB1P23443 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RPS6KB1P23443 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RPS6KB1P23443 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RPS6KB1P23443 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RPS6KB1P23443 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RPS6KB1P23443 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RPS6KB1P23443 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.73
RPS6KB1P23443 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RPS6KB1P23443 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RPS6KB1P23443 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RPS6KB1P23443 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RPS6KB1P23443 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RPS6KB1P23443 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RPS6KB1P23443 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RPS6KB1P23443 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RPS6KB1P23443 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RPS6KB1P23443 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RPS6KB1P23443 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RPS6KB1P23443 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
RPS6KB1P23443 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
RPS6KB1P23443 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
RPS6KB1P23443 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RPS6KB1P23443 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RPS6KB1P23443 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RPS6KB1P23443 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RPS6KB1P23443 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RPS6KB1P23443 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RPS6KB1P23443 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
RPS6KB1P23443 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RPS6KB1P23443 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RPS6KB1P23443 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.91■■■□□ 2.7
RPS6KB1P23443 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
RPS6KB1P23443 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RPS6KB1P23443 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RPS6KB1P23443 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
RPS6KB1P23443 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RPS6KB1P23443 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RPS6KB1P23443 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RPS6KB1P23443 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RPS6KB1P23443 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RPS6KB1P23443 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RPS6KB1P23443 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RPS6KB1P23443 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RPS6KB1P23443 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
RPS6KB1P23443 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RPS6KB1P23443 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RPS6KB1P23443 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RPS6KB1P23443 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
RPS6KB1P23443 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
RPS6KB1P23443 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
RPS6KB1P23443 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RPS6KB1P23443 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RPS6KB1P23443 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RPS6KB1P23443 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RPS6KB1P23443 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RPS6KB1P23443 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RPS6KB1P23443 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
RPS6KB1P23443 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RPS6KB1P23443 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
RPS6KB1P23443 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RPS6KB1P23443 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RPS6KB1P23443 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
RPS6KB1P23443 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RPS6KB1P23443 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RPS6KB1P23443 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RPS6KB1P23443 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RPS6KB1P23443 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RPS6KB1P23443 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RPS6KB1P23443 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RPS6KB1P23443 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RPS6KB1P23443 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RPS6KB1P23443 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RPS6KB1P23443 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RPS6KB1P23443 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RPS6KB1P23443 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RPS6KB1P23443 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RPS6KB1P23443 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RPS6KB1P23443 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
RPS6KB1P23443 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RPS6KB1P23443 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RPS6KB1P23443 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RPS6KB1P23443 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
RPS6KB1P23443 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
RPS6KB1P23443 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RPS6KB1P23443 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
RPS6KB1P23443 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RPS6KB1P23443 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RPS6KB1P23443 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RPS6KB1P23443 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RPS6KB1P23443 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RPS6KB1P23443 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
RPS6KB1P23443 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RPS6KB1P23443 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RPS6KB1P23443 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RPS6KB1P23443 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms