Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GCSHP23434 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GCSHP23434 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GCSHP23434 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GCSHP23434 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCSHP23434 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCSHP23434 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCSHP23434 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCSHP23434 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCSHP23434 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCSHP23434 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCSHP23434 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCSHP23434 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCSHP23434 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GCSHP23434 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCSHP23434 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCSHP23434 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCSHP23434 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCSHP23434 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCSHP23434 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCSHP23434 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCSHP23434 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCSHP23434 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCSHP23434 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCSHP23434 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCSHP23434 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCSHP23434 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCSHP23434 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCSHP23434 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCSHP23434 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCSHP23434 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCSHP23434 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCSHP23434 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCSHP23434 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCSHP23434 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GCSHP23434 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCSHP23434 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCSHP23434 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCSHP23434 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCSHP23434 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCSHP23434 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCSHP23434 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCSHP23434 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCSHP23434 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCSHP23434 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCSHP23434 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCSHP23434 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCSHP23434 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCSHP23434 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCSHP23434 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCSHP23434 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCSHP23434 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCSHP23434 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCSHP23434 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCSHP23434 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCSHP23434 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCSHP23434 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCSHP23434 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCSHP23434 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCSHP23434 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCSHP23434 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCSHP23434 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCSHP23434 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCSHP23434 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCSHP23434 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCSHP23434 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCSHP23434 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCSHP23434 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCSHP23434 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCSHP23434 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCSHP23434 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCSHP23434 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCSHP23434 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCSHP23434 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GCSHP23434 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCSHP23434 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCSHP23434 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCSHP23434 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCSHP23434 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCSHP23434 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCSHP23434 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCSHP23434 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCSHP23434 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCSHP23434 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCSHP23434 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCSHP23434 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCSHP23434 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCSHP23434 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCSHP23434 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCSHP23434 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCSHP23434 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCSHP23434 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCSHP23434 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCSHP23434 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCSHP23434 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCSHP23434 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCSHP23434 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCSHP23434 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCSHP23434 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCSHP23434 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms