Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCEA1P23193 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCEA1P23193 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCEA1P23193 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TCEA1P23193 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCEA1P23193 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCEA1P23193 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCEA1P23193 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCEA1P23193 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCEA1P23193 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCEA1P23193 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCEA1P23193 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCEA1P23193 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCEA1P23193 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCEA1P23193 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCEA1P23193 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCEA1P23193 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCEA1P23193 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCEA1P23193 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCEA1P23193 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCEA1P23193 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCEA1P23193 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCEA1P23193 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCEA1P23193 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCEA1P23193 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCEA1P23193 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCEA1P23193 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCEA1P23193 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCEA1P23193 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCEA1P23193 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCEA1P23193 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCEA1P23193 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCEA1P23193 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCEA1P23193 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCEA1P23193 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCEA1P23193 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCEA1P23193 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCEA1P23193 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCEA1P23193 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCEA1P23193 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCEA1P23193 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCEA1P23193 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCEA1P23193 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCEA1P23193 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCEA1P23193 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCEA1P23193 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCEA1P23193 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCEA1P23193 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCEA1P23193 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCEA1P23193 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCEA1P23193 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TCEA1P23193 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TCEA1P23193 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCEA1P23193 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCEA1P23193 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCEA1P23193 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCEA1P23193 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCEA1P23193 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCEA1P23193 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TCEA1P23193 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCEA1P23193 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TCEA1P23193 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCEA1P23193 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCEA1P23193 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCEA1P23193 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCEA1P23193 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCEA1P23193 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCEA1P23193 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCEA1P23193 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCEA1P23193 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCEA1P23193 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCEA1P23193 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCEA1P23193 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCEA1P23193 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCEA1P23193 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCEA1P23193 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCEA1P23193 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCEA1P23193 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCEA1P23193 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCEA1P23193 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCEA1P23193 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCEA1P23193 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCEA1P23193 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCEA1P23193 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TCEA1P23193 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCEA1P23193 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCEA1P23193 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEA1P23193 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEA1P23193 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEA1P23193 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEA1P23193 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEA1P23193 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEA1P23193 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEA1P23193 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCEA1P23193 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCEA1P23193 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEA1P23193 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEA1P23193 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEA1P23193 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCEA1P23193 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms