Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ABCB4P21439 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCB4P21439 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCB4P21439 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ABCB4P21439 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ABCB4P21439 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCB4P21439 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCB4P21439 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCB4P21439 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCB4P21439 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCB4P21439 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCB4P21439 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCB4P21439 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCB4P21439 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCB4P21439 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCB4P21439 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCB4P21439 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCB4P21439 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCB4P21439 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCB4P21439 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCB4P21439 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCB4P21439 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCB4P21439 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCB4P21439 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCB4P21439 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCB4P21439 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCB4P21439 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCB4P21439 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCB4P21439 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCB4P21439 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCB4P21439 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCB4P21439 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCB4P21439 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCB4P21439 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCB4P21439 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCB4P21439 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCB4P21439 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCB4P21439 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCB4P21439 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCB4P21439 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCB4P21439 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCB4P21439 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCB4P21439 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCB4P21439 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ABCB4P21439 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCB4P21439 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCB4P21439 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCB4P21439 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCB4P21439 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCB4P21439 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCB4P21439 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCB4P21439 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCB4P21439 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCB4P21439 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCB4P21439 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCB4P21439 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCB4P21439 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCB4P21439 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCB4P21439 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCB4P21439 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCB4P21439 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCB4P21439 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCB4P21439 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCB4P21439 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCB4P21439 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCB4P21439 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCB4P21439 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCB4P21439 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCB4P21439 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCB4P21439 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCB4P21439 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCB4P21439 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCB4P21439 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCB4P21439 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCB4P21439 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCB4P21439 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCB4P21439 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCB4P21439 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCB4P21439 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCB4P21439 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCB4P21439 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCB4P21439 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCB4P21439 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCB4P21439 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCB4P21439 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCB4P21439 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCB4P21439 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCB4P21439 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCB4P21439 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCB4P21439 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCB4P21439 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCB4P21439 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCB4P21439 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCB4P21439 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCB4P21439 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCB4P21439 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCB4P21439 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCB4P21439 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCB4P21439 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCB4P21439 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms