Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CASTP20810 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CASTP20810 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CASTP20810 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CASTP20810 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CASTP20810 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CASTP20810 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CASTP20810 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CASTP20810 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CASTP20810 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CASTP20810 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CASTP20810 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CASTP20810 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CASTP20810 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CASTP20810 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CASTP20810 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CASTP20810 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CASTP20810 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CASTP20810 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CASTP20810 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CASTP20810 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CASTP20810 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CASTP20810 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CASTP20810 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CASTP20810 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CASTP20810 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CASTP20810 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CASTP20810 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CASTP20810 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CASTP20810 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CASTP20810 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CASTP20810 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CASTP20810 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CASTP20810 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CASTP20810 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CASTP20810 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CASTP20810 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CASTP20810 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CASTP20810 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CASTP20810 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CASTP20810 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CASTP20810 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CASTP20810 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CASTP20810 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CASTP20810 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CASTP20810 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CASTP20810 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CASTP20810 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CASTP20810 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CASTP20810 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CASTP20810 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CASTP20810 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CASTP20810 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CASTP20810 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CASTP20810 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CASTP20810 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CASTP20810 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CASTP20810 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CASTP20810 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CASTP20810 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CASTP20810 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CASTP20810 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CASTP20810 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
CASTP20810 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CASTP20810 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CASTP20810 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CASTP20810 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
CASTP20810 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CASTP20810 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CASTP20810 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CASTP20810 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CASTP20810 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CASTP20810 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CASTP20810 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
CASTP20810 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CASTP20810 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CASTP20810 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CASTP20810 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CASTP20810 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CASTP20810 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CASTP20810 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CASTP20810 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CASTP20810 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CASTP20810 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
CASTP20810 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CASTP20810 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CASTP20810 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CASTP20810 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
CASTP20810 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.69
CASTP20810 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CASTP20810 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CASTP20810 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CASTP20810 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CASTP20810 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CASTP20810 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CASTP20810 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CASTP20810 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CASTP20810 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CASTP20810 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CASTP20810 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms