Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SDSP20132 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SDSP20132 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SDSP20132 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SDSP20132 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SDSP20132 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SDSP20132 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SDSP20132 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SDSP20132 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SDSP20132 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SDSP20132 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SDSP20132 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SDSP20132 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SDSP20132 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SDSP20132 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SDSP20132 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SDSP20132 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SDSP20132 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SDSP20132 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SDSP20132 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SDSP20132 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SDSP20132 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SDSP20132 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SDSP20132 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SDSP20132 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SDSP20132 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SDSP20132 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33■■■□□ 2.87
SDSP20132 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SDSP20132 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SDSP20132 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SDSP20132 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SDSP20132 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SDSP20132 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SDSP20132 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SDSP20132 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SDSP20132 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
SDSP20132 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
SDSP20132 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SDSP20132 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SDSP20132 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SDSP20132 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SDSP20132 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SDSP20132 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SDSP20132 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SDSP20132 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SDSP20132 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SDSP20132 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SDSP20132 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
SDSP20132 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SDSP20132 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SDSP20132 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SDSP20132 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SDSP20132 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SDSP20132 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SDSP20132 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SDSP20132 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SDSP20132 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SDSP20132 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SDSP20132 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SDSP20132 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SDSP20132 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
SDSP20132 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SDSP20132 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SDSP20132 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SDSP20132 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SDSP20132 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SDSP20132 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SDSP20132 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SDSP20132 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SDSP20132 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SDSP20132 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SDSP20132 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SDSP20132 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SDSP20132 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SDSP20132 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SDSP20132 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SDSP20132 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SDSP20132 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SDSP20132 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SDSP20132 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SDSP20132 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SDSP20132 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SDSP20132 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
SDSP20132 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SDSP20132 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SDSP20132 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SDSP20132 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SDSP20132 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SDSP20132 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SDSP20132 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SDSP20132 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SDSP20132 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SDSP20132 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SDSP20132 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SDSP20132 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SDSP20132 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
SDSP20132 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SDSP20132 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SDSP20132 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SDSP20132 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms