Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT4P19013 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT4P19013 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT4P19013 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT4P19013 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT4P19013 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT4P19013 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT4P19013 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT4P19013 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT4P19013 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT4P19013 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT4P19013 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT4P19013 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT4P19013 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT4P19013 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT4P19013 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT4P19013 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT4P19013 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT4P19013 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT4P19013 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT4P19013 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT4P19013 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT4P19013 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT4P19013 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT4P19013 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT4P19013 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT4P19013 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT4P19013 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT4P19013 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT4P19013 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT4P19013 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT4P19013 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT4P19013 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT4P19013 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT4P19013 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT4P19013 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT4P19013 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT4P19013 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT4P19013 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT4P19013 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT4P19013 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT4P19013 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT4P19013 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT4P19013 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT4P19013 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT4P19013 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT4P19013 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT4P19013 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT4P19013 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT4P19013 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT4P19013 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT4P19013 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT4P19013 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT4P19013 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT4P19013 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT4P19013 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT4P19013 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT4P19013 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRT4P19013 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT4P19013 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT4P19013 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT4P19013 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT4P19013 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT4P19013 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT4P19013 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT4P19013 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT4P19013 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT4P19013 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT4P19013 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT4P19013 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT4P19013 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT4P19013 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT4P19013 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT4P19013 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT4P19013 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT4P19013 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT4P19013 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT4P19013 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT4P19013 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT4P19013 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT4P19013 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT4P19013 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT4P19013 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT4P19013 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT4P19013 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT4P19013 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT4P19013 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT4P19013 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT4P19013 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT4P19013 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT4P19013 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT4P19013 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT4P19013 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT4P19013 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT4P19013 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT4P19013 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT4P19013 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT4P19013 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT4P19013 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT4P19013 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms