Protein–RNA interactions for Protein: P17706

PTPN2, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN2P17706 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPN2P17706 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPN2P17706 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPN2P17706 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPN2P17706 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPN2P17706 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPN2P17706 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPN2P17706 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN2P17706 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPN2P17706 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPN2P17706 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPN2P17706 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN2P17706 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN2P17706 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN2P17706 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN2P17706 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN2P17706 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN2P17706 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPN2P17706 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPN2P17706 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPN2P17706 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPN2P17706 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPN2P17706 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPN2P17706 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN2P17706 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN2P17706 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN2P17706 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN2P17706 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN2P17706 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPN2P17706 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPN2P17706 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPN2P17706 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN2P17706 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN2P17706 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN2P17706 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN2P17706 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN2P17706 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN2P17706 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN2P17706 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN2P17706 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN2P17706 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN2P17706 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN2P17706 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN2P17706 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPN2P17706 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPN2P17706 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPN2P17706 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN2P17706 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN2P17706 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN2P17706 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN2P17706 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN2P17706 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN2P17706 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN2P17706 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPN2P17706 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPN2P17706 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN2P17706 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN2P17706 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN2P17706 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN2P17706 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPN2P17706 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN2P17706 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN2P17706 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPN2P17706 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPN2P17706 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPN2P17706 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPN2P17706 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPN2P17706 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPN2P17706 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPN2P17706 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPN2P17706 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPN2P17706 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPN2P17706 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN2P17706 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN2P17706 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN2P17706 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN2P17706 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN2P17706 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPN2P17706 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPN2P17706 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN2P17706 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN2P17706 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN2P17706 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN2P17706 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPN2P17706 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPN2P17706 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPN2P17706 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN2P17706 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN2P17706 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN2P17706 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN2P17706 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN2P17706 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPN2P17706 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPN2P17706 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPN2P17706 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPN2P17706 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPN2P17706 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPN2P17706 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPN2P17706 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPN2P17706 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms