Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA2P17301 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA2P17301 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA2P17301 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA2P17301 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA2P17301 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA2P17301 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA2P17301 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA2P17301 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA2P17301 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGA2P17301 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGA2P17301 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA2P17301 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA2P17301 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA2P17301 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA2P17301 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA2P17301 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA2P17301 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA2P17301 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA2P17301 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA2P17301 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA2P17301 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA2P17301 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA2P17301 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA2P17301 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA2P17301 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITGA2P17301 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITGA2P17301 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA2P17301 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA2P17301 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA2P17301 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA2P17301 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA2P17301 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA2P17301 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA2P17301 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA2P17301 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA2P17301 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA2P17301 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA2P17301 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA2P17301 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA2P17301 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA2P17301 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA2P17301 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA2P17301 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA2P17301 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA2P17301 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA2P17301 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA2P17301 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA2P17301 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA2P17301 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA2P17301 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA2P17301 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA2P17301 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA2P17301 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA2P17301 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA2P17301 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA2P17301 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA2P17301 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA2P17301 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA2P17301 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA2P17301 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA2P17301 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA2P17301 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA2P17301 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA2P17301 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA2P17301 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA2P17301 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA2P17301 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA2P17301 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA2P17301 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA2P17301 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA2P17301 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA2P17301 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA2P17301 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA2P17301 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA2P17301 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA2P17301 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA2P17301 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA2P17301 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA2P17301 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA2P17301 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA2P17301 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA2P17301 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA2P17301 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA2P17301 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA2P17301 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA2P17301 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA2P17301 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA2P17301 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA2P17301 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA2P17301 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA2P17301 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA2P17301 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA2P17301 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA2P17301 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA2P17301 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA2P17301 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA2P17301 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA2P17301 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA2P17301 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms