Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOT1P17174 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOT1P17174 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOT1P17174 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOT1P17174 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOT1P17174 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOT1P17174 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOT1P17174 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOT1P17174 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOT1P17174 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOT1P17174 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOT1P17174 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOT1P17174 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOT1P17174 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOT1P17174 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOT1P17174 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOT1P17174 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOT1P17174 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOT1P17174 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GOT1P17174 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOT1P17174 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GOT1P17174 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GOT1P17174 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOT1P17174 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOT1P17174 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GOT1P17174 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOT1P17174 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOT1P17174 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOT1P17174 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOT1P17174 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOT1P17174 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOT1P17174 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOT1P17174 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOT1P17174 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOT1P17174 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOT1P17174 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOT1P17174 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOT1P17174 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOT1P17174 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOT1P17174 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOT1P17174 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOT1P17174 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOT1P17174 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOT1P17174 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GOT1P17174 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOT1P17174 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GOT1P17174 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOT1P17174 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOT1P17174 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOT1P17174 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOT1P17174 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOT1P17174 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GOT1P17174 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOT1P17174 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOT1P17174 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOT1P17174 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOT1P17174 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOT1P17174 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOT1P17174 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOT1P17174 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOT1P17174 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOT1P17174 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOT1P17174 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GOT1P17174 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOT1P17174 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GOT1P17174 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOT1P17174 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOT1P17174 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOT1P17174 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOT1P17174 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOT1P17174 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOT1P17174 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GOT1P17174 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GOT1P17174 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GOT1P17174 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GOT1P17174 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
GOT1P17174 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GOT1P17174 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GOT1P17174 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GOT1P17174 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GOT1P17174 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GOT1P17174 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOT1P17174 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOT1P17174 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOT1P17174 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GOT1P17174 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GOT1P17174 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GOT1P17174 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GOT1P17174 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GOT1P17174 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GOT1P17174 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GOT1P17174 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GOT1P17174 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GOT1P17174 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
GOT1P17174 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GOT1P17174 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOT1P17174 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOT1P17174 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOT1P17174 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOT1P17174 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms