Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPB42P16452 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPB42P16452 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPB42P16452 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EPB42P16452 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EPB42P16452 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EPB42P16452 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EPB42P16452 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EPB42P16452 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EPB42P16452 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EPB42P16452 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EPB42P16452 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EPB42P16452 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EPB42P16452 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EPB42P16452 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EPB42P16452 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EPB42P16452 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EPB42P16452 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EPB42P16452 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EPB42P16452 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EPB42P16452 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EPB42P16452 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EPB42P16452 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPB42P16452 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPB42P16452 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPB42P16452 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPB42P16452 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPB42P16452 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EPB42P16452 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EPB42P16452 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPB42P16452 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPB42P16452 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPB42P16452 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPB42P16452 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPB42P16452 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EPB42P16452 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPB42P16452 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPB42P16452 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPB42P16452 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
EPB42P16452 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EPB42P16452 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EPB42P16452 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EPB42P16452 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EPB42P16452 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPB42P16452 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPB42P16452 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPB42P16452 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPB42P16452 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EPB42P16452 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EPB42P16452 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPB42P16452 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPB42P16452 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPB42P16452 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPB42P16452 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPB42P16452 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB42P16452 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB42P16452 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPB42P16452 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPB42P16452 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPB42P16452 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB42P16452 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB42P16452 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB42P16452 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB42P16452 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB42P16452 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB42P16452 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPB42P16452 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPB42P16452 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPB42P16452 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPB42P16452 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPB42P16452 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EPB42P16452 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EPB42P16452 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EPB42P16452 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPB42P16452 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EPB42P16452 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EPB42P16452 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EPB42P16452 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EPB42P16452 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EPB42P16452 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
EPB42P16452 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EPB42P16452 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPB42P16452 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPB42P16452 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPB42P16452 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPB42P16452 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPB42P16452 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPB42P16452 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPB42P16452 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPB42P16452 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPB42P16452 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPB42P16452 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPB42P16452 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPB42P16452 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPB42P16452 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPB42P16452 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EPB42P16452 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
EPB42P16452 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EPB42P16452 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EPB42P16452 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms