Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRA1P14867 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABRA1P14867 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRA1P14867 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRA1P14867 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRA1P14867 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRA1P14867 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRA1P14867 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRA1P14867 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRA1P14867 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRA1P14867 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRA1P14867 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRA1P14867 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRA1P14867 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRA1P14867 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRA1P14867 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRA1P14867 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRA1P14867 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRA1P14867 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRA1P14867 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRA1P14867 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRA1P14867 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRA1P14867 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRA1P14867 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRA1P14867 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRA1P14867 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRA1P14867 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRA1P14867 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRA1P14867 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRA1P14867 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRA1P14867 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRA1P14867 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRA1P14867 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRA1P14867 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRA1P14867 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GABRA1P14867 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABRA1P14867 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABRA1P14867 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABRA1P14867 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRA1P14867 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRA1P14867 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRA1P14867 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRA1P14867 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRA1P14867 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRA1P14867 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRA1P14867 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRA1P14867 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRA1P14867 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRA1P14867 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRA1P14867 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRA1P14867 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRA1P14867 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRA1P14867 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRA1P14867 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRA1P14867 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRA1P14867 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRA1P14867 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRA1P14867 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRA1P14867 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRA1P14867 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRA1P14867 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRA1P14867 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRA1P14867 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRA1P14867 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRA1P14867 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRA1P14867 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRA1P14867 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRA1P14867 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRA1P14867 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRA1P14867 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRA1P14867 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRA1P14867 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRA1P14867 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRA1P14867 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRA1P14867 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRA1P14867 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRA1P14867 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRA1P14867 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRA1P14867 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRA1P14867 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRA1P14867 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRA1P14867 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRA1P14867 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRA1P14867 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRA1P14867 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRA1P14867 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRA1P14867 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRA1P14867 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRA1P14867 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRA1P14867 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRA1P14867 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRA1P14867 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRA1P14867 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRA1P14867 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRA1P14867 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRA1P14867 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRA1P14867 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRA1P14867 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRA1P14867 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRA1P14867 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms