Protein–RNA interactions for Protein: P14780

MMP9, Matrix metalloproteinase-9, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP9P14780 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP9P14780 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP9P14780 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP9P14780 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP9P14780 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP9P14780 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP9P14780 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP9P14780 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP9P14780 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP9P14780 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP9P14780 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP9P14780 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP9P14780 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP9P14780 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP9P14780 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP9P14780 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP9P14780 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP9P14780 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP9P14780 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP9P14780 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP9P14780 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP9P14780 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP9P14780 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP9P14780 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP9P14780 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP9P14780 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP9P14780 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP9P14780 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP9P14780 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP9P14780 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP9P14780 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP9P14780 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP9P14780 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP9P14780 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP9P14780 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP9P14780 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP9P14780 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP9P14780 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP9P14780 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP9P14780 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP9P14780 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP9P14780 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MMP9P14780 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP9P14780 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP9P14780 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP9P14780 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP9P14780 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP9P14780 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP9P14780 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP9P14780 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP9P14780 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP9P14780 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP9P14780 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP9P14780 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP9P14780 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP9P14780 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP9P14780 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP9P14780 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP9P14780 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP9P14780 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP9P14780 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP9P14780 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP9P14780 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP9P14780 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP9P14780 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP9P14780 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP9P14780 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP9P14780 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MMP9P14780 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP9P14780 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP9P14780 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP9P14780 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP9P14780 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP9P14780 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP9P14780 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP9P14780 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP9P14780 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP9P14780 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP9P14780 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP9P14780 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP9P14780 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP9P14780 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP9P14780 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP9P14780 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP9P14780 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP9P14780 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP9P14780 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP9P14780 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP9P14780 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP9P14780 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP9P14780 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP9P14780 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP9P14780 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP9P14780 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP9P14780 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP9P14780 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP9P14780 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP9P14780 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP9P14780 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP9P14780 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms