Protein–RNA interactions for Protein: P13674

P4HA1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4HA1P13674 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
P4HA1P13674 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
P4HA1P13674 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
P4HA1P13674 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
P4HA1P13674 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
P4HA1P13674 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
P4HA1P13674 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
P4HA1P13674 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
P4HA1P13674 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
P4HA1P13674 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
P4HA1P13674 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
P4HA1P13674 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
P4HA1P13674 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
P4HA1P13674 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
P4HA1P13674 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
P4HA1P13674 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
P4HA1P13674 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
P4HA1P13674 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
P4HA1P13674 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
P4HA1P13674 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
P4HA1P13674 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
P4HA1P13674 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
P4HA1P13674 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
P4HA1P13674 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
P4HA1P13674 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
P4HA1P13674 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
P4HA1P13674 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
P4HA1P13674 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
P4HA1P13674 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
P4HA1P13674 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
P4HA1P13674 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
P4HA1P13674 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
P4HA1P13674 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
P4HA1P13674 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
P4HA1P13674 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
P4HA1P13674 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
P4HA1P13674 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
P4HA1P13674 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
P4HA1P13674 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
P4HA1P13674 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
P4HA1P13674 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
P4HA1P13674 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
P4HA1P13674 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
P4HA1P13674 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
P4HA1P13674 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
P4HA1P13674 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
P4HA1P13674 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
P4HA1P13674 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
P4HA1P13674 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
P4HA1P13674 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
P4HA1P13674 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
P4HA1P13674 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
P4HA1P13674 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
P4HA1P13674 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
P4HA1P13674 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
P4HA1P13674 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
P4HA1P13674 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
P4HA1P13674 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
P4HA1P13674 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
P4HA1P13674 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
P4HA1P13674 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
P4HA1P13674 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
P4HA1P13674 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
P4HA1P13674 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
P4HA1P13674 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
P4HA1P13674 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
P4HA1P13674 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
P4HA1P13674 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
P4HA1P13674 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
P4HA1P13674 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
P4HA1P13674 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
P4HA1P13674 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
P4HA1P13674 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
P4HA1P13674 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
P4HA1P13674 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
P4HA1P13674 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
P4HA1P13674 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
P4HA1P13674 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
P4HA1P13674 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
P4HA1P13674 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
P4HA1P13674 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
P4HA1P13674 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
P4HA1P13674 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
P4HA1P13674 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
P4HA1P13674 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
P4HA1P13674 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
P4HA1P13674 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
P4HA1P13674 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
P4HA1P13674 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
P4HA1P13674 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
P4HA1P13674 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
P4HA1P13674 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
P4HA1P13674 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
P4HA1P13674 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
P4HA1P13674 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
P4HA1P13674 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
P4HA1P13674 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
P4HA1P13674 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
P4HA1P13674 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
P4HA1P13674 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms