Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GP1BBP13224 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GP1BBP13224 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GP1BBP13224 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GP1BBP13224 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GP1BBP13224 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GP1BBP13224 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GP1BBP13224 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GP1BBP13224 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GP1BBP13224 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GP1BBP13224 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GP1BBP13224 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GP1BBP13224 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GP1BBP13224 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GP1BBP13224 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GP1BBP13224 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GP1BBP13224 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GP1BBP13224 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GP1BBP13224 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GP1BBP13224 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GP1BBP13224 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GP1BBP13224 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GP1BBP13224 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GP1BBP13224 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GP1BBP13224 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GP1BBP13224 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GP1BBP13224 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GP1BBP13224 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GP1BBP13224 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GP1BBP13224 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GP1BBP13224 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GP1BBP13224 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GP1BBP13224 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GP1BBP13224 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GP1BBP13224 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GP1BBP13224 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GP1BBP13224 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GP1BBP13224 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GP1BBP13224 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GP1BBP13224 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GP1BBP13224 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GP1BBP13224 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GP1BBP13224 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GP1BBP13224 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GP1BBP13224 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GP1BBP13224 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GP1BBP13224 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GP1BBP13224 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GP1BBP13224 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GP1BBP13224 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GP1BBP13224 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GP1BBP13224 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GP1BBP13224 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GP1BBP13224 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GP1BBP13224 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GP1BBP13224 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GP1BBP13224 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GP1BBP13224 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GP1BBP13224 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GP1BBP13224 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GP1BBP13224 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GP1BBP13224 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GP1BBP13224 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GP1BBP13224 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GP1BBP13224 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GP1BBP13224 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GP1BBP13224 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GP1BBP13224 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GP1BBP13224 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GP1BBP13224 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GP1BBP13224 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GP1BBP13224 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GP1BBP13224 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GP1BBP13224 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GP1BBP13224 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GP1BBP13224 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GP1BBP13224 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GP1BBP13224 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GP1BBP13224 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GP1BBP13224 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GP1BBP13224 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GP1BBP13224 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GP1BBP13224 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GP1BBP13224 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GP1BBP13224 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GP1BBP13224 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GP1BBP13224 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GP1BBP13224 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GP1BBP13224 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GP1BBP13224 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GP1BBP13224 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GP1BBP13224 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GP1BBP13224 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GP1BBP13224 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GP1BBP13224 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GP1BBP13224 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GP1BBP13224 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GP1BBP13224 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GP1BBP13224 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GP1BBP13224 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms