Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VPREB1P12018 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VPREB1P12018 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPREB1P12018 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPREB1P12018 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPREB1P12018 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPREB1P12018 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPREB1P12018 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPREB1P12018 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPREB1P12018 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPREB1P12018 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPREB1P12018 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPREB1P12018 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPREB1P12018 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPREB1P12018 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPREB1P12018 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPREB1P12018 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPREB1P12018 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPREB1P12018 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPREB1P12018 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPREB1P12018 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPREB1P12018 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPREB1P12018 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPREB1P12018 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPREB1P12018 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPREB1P12018 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPREB1P12018 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPREB1P12018 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPREB1P12018 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPREB1P12018 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPREB1P12018 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPREB1P12018 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPREB1P12018 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPREB1P12018 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPREB1P12018 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPREB1P12018 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPREB1P12018 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPREB1P12018 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPREB1P12018 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VPREB1P12018 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPREB1P12018 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPREB1P12018 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPREB1P12018 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPREB1P12018 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPREB1P12018 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPREB1P12018 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPREB1P12018 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPREB1P12018 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPREB1P12018 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPREB1P12018 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPREB1P12018 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPREB1P12018 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPREB1P12018 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
VPREB1P12018 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VPREB1P12018 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VPREB1P12018 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPREB1P12018 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPREB1P12018 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VPREB1P12018 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VPREB1P12018 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VPREB1P12018 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VPREB1P12018 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VPREB1P12018 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VPREB1P12018 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VPREB1P12018 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPREB1P12018 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPREB1P12018 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPREB1P12018 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPREB1P12018 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPREB1P12018 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPREB1P12018 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPREB1P12018 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPREB1P12018 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPREB1P12018 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPREB1P12018 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPREB1P12018 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VPREB1P12018 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPREB1P12018 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPREB1P12018 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPREB1P12018 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPREB1P12018 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPREB1P12018 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPREB1P12018 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPREB1P12018 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPREB1P12018 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPREB1P12018 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPREB1P12018 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPREB1P12018 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPREB1P12018 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPREB1P12018 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPREB1P12018 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPREB1P12018 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPREB1P12018 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPREB1P12018 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPREB1P12018 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPREB1P12018 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPREB1P12018 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPREB1P12018 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPREB1P12018 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VPREB1P12018 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms