Protein–RNA interactions for Protein: P10253

GAA, Lysosomal alpha-glucosidase, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAAP10253 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAAP10253 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAAP10253 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAAP10253 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAAP10253 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAAP10253 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GAAP10253 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAAP10253 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAAP10253 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAAP10253 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAAP10253 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAAP10253 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GAAP10253 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GAAP10253 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAAP10253 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAAP10253 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAAP10253 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAAP10253 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAAP10253 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAAP10253 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAAP10253 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAAP10253 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAAP10253 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAAP10253 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GAAP10253 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAAP10253 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAAP10253 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAAP10253 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAAP10253 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAAP10253 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAAP10253 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAAP10253 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAAP10253 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAAP10253 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAAP10253 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAAP10253 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAAP10253 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAAP10253 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAAP10253 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAAP10253 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAAP10253 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAAP10253 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAAP10253 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAAP10253 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAAP10253 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAAP10253 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAAP10253 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAAP10253 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAAP10253 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAAP10253 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAAP10253 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAAP10253 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAAP10253 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAAP10253 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GAAP10253 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GAAP10253 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GAAP10253 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GAAP10253 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GAAP10253 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GAAP10253 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GAAP10253 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GAAP10253 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GAAP10253 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GAAP10253 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GAAP10253 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GAAP10253 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GAAP10253 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GAAP10253 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GAAP10253 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GAAP10253 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GAAP10253 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GAAP10253 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GAAP10253 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GAAP10253 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GAAP10253 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GAAP10253 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GAAP10253 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAAP10253 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAAP10253 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAAP10253 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAAP10253 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAAP10253 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GAAP10253 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GAAP10253 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAAP10253 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAAP10253 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAAP10253 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAAP10253 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAAP10253 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GAAP10253 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GAAP10253 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GAAP10253 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GAAP10253 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GAAP10253 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GAAP10253 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GAAP10253 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GAAP10253 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GAAP10253 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAAP10253 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GAAP10253 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms