Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRGAP2BP0DMP2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRGAP2BP0DMP2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRGAP2BP0DMP2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRGAP2BP0DMP2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRGAP2BP0DMP2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRGAP2BP0DMP2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRGAP2BP0DMP2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRGAP2BP0DMP2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRGAP2BP0DMP2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRGAP2BP0DMP2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRGAP2BP0DMP2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRGAP2BP0DMP2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRGAP2BP0DMP2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRGAP2BP0DMP2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRGAP2BP0DMP2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRGAP2BP0DMP2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRGAP2BP0DMP2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRGAP2BP0DMP2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRGAP2BP0DMP2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRGAP2BP0DMP2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SRGAP2BP0DMP2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRGAP2BP0DMP2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SRGAP2BP0DMP2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SRGAP2BP0DMP2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SRGAP2BP0DMP2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SRGAP2BP0DMP2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SRGAP2BP0DMP2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRGAP2BP0DMP2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRGAP2BP0DMP2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRGAP2BP0DMP2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRGAP2BP0DMP2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SRGAP2BP0DMP2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRGAP2BP0DMP2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRGAP2BP0DMP2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRGAP2BP0DMP2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRGAP2BP0DMP2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRGAP2BP0DMP2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRGAP2BP0DMP2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRGAP2BP0DMP2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRGAP2BP0DMP2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SRGAP2BP0DMP2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SRGAP2BP0DMP2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SRGAP2BP0DMP2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SRGAP2BP0DMP2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SRGAP2BP0DMP2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRGAP2BP0DMP2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRGAP2BP0DMP2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRGAP2BP0DMP2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRGAP2BP0DMP2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRGAP2BP0DMP2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SRGAP2BP0DMP2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SRGAP2BP0DMP2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRGAP2BP0DMP2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SRGAP2BP0DMP2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SRGAP2BP0DMP2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SRGAP2BP0DMP2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRGAP2BP0DMP2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRGAP2BP0DMP2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRGAP2BP0DMP2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRGAP2BP0DMP2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRGAP2BP0DMP2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRGAP2BP0DMP2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SRGAP2BP0DMP2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRGAP2BP0DMP2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRGAP2BP0DMP2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRGAP2BP0DMP2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRGAP2BP0DMP2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRGAP2BP0DMP2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRGAP2BP0DMP2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRGAP2BP0DMP2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRGAP2BP0DMP2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRGAP2BP0DMP2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRGAP2BP0DMP2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRGAP2BP0DMP2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRGAP2BP0DMP2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRGAP2BP0DMP2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRGAP2BP0DMP2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRGAP2BP0DMP2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRGAP2BP0DMP2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRGAP2BP0DMP2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRGAP2BP0DMP2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRGAP2BP0DMP2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRGAP2BP0DMP2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRGAP2BP0DMP2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRGAP2BP0DMP2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SRGAP2BP0DMP2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRGAP2BP0DMP2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRGAP2BP0DMP2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SRGAP2BP0DMP2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRGAP2BP0DMP2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRGAP2BP0DMP2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRGAP2BP0DMP2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRGAP2BP0DMP2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRGAP2BP0DMP2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRGAP2BP0DMP2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRGAP2BP0DMP2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SRGAP2BP0DMP2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SRGAP2BP0DMP2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRGAP2BP0DMP2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms