Protein–RNA interactions for Protein: P0CG33

GOLGA6D, Golgin subfamily A member 6D, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6DP0CG33 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLGA6DP0CG33 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLGA6DP0CG33 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GOLGA6DP0CG33 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA6DP0CG33 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA6DP0CG33 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA6DP0CG33 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA6DP0CG33 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA6DP0CG33 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA6DP0CG33 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA6DP0CG33 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA6DP0CG33 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA6DP0CG33 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA6DP0CG33 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA6DP0CG33 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA6DP0CG33 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA6DP0CG33 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA6DP0CG33 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA6DP0CG33 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GOLGA6DP0CG33 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA6DP0CG33 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA6DP0CG33 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA6DP0CG33 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA6DP0CG33 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA6DP0CG33 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA6DP0CG33 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA6DP0CG33 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA6DP0CG33 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA6DP0CG33 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA6DP0CG33 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA6DP0CG33 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA6DP0CG33 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA6DP0CG33 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA6DP0CG33 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA6DP0CG33 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA6DP0CG33 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA6DP0CG33 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6DP0CG33 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6DP0CG33 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6DP0CG33 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6DP0CG33 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA6DP0CG33 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA6DP0CG33 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA6DP0CG33 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA6DP0CG33 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA6DP0CG33 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA6DP0CG33 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA6DP0CG33 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA6DP0CG33 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA6DP0CG33 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA6DP0CG33 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA6DP0CG33 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA6DP0CG33 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA6DP0CG33 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA6DP0CG33 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOLGA6DP0CG33 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOLGA6DP0CG33 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA6DP0CG33 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA6DP0CG33 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA6DP0CG33 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6DP0CG33 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6DP0CG33 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6DP0CG33 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6DP0CG33 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6DP0CG33 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6DP0CG33 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6DP0CG33 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6DP0CG33 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6DP0CG33 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA6DP0CG33 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA6DP0CG33 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA6DP0CG33 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA6DP0CG33 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA6DP0CG33 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6DP0CG33 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6DP0CG33 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA6DP0CG33 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA6DP0CG33 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA6DP0CG33 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA6DP0CG33 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA6DP0CG33 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6DP0CG33 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6DP0CG33 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA6DP0CG33 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA6DP0CG33 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA6DP0CG33 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA6DP0CG33 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA6DP0CG33 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA6DP0CG33 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA6DP0CG33 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA6DP0CG33 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA6DP0CG33 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA6DP0CG33 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA6DP0CG33 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA6DP0CG33 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA6DP0CG33 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA6DP0CG33 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA6DP0CG33 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA6DP0CG33 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GOLGA6DP0CG33 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms