Protein–RNA interactions for Protein: P0C879

Putative uncharacterized protein FLJ43185, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C879 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P0C879 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P0C879 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P0C879 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P0C879 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P0C879 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P0C879 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P0C879 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P0C879 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P0C879 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P0C879 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P0C879 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P0C879 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P0C879 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P0C879 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P0C879 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P0C879 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
P0C879 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P0C879 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P0C879 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P0C879 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P0C879 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P0C879 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P0C879 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P0C879 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P0C879 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P0C879 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P0C879 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P0C879 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P0C879 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P0C879 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P0C879 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P0C879 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P0C879 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P0C879 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P0C879 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P0C879 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
P0C879 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
P0C879 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P0C879 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P0C879 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P0C879 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P0C879 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P0C879 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P0C879 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
P0C879 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P0C879 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P0C879 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P0C879 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P0C879 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P0C879 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
P0C879 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P0C879 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P0C879 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P0C879 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
P0C879 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
P0C879 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
P0C879 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
P0C879 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P0C879 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P0C879 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
P0C879 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P0C879 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P0C879 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P0C879 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P0C879 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P0C879 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P0C879 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
P0C879 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
P0C879 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
P0C879 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P0C879 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
P0C879 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P0C879 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P0C879 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P0C879 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P0C879 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P0C879 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
P0C879 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P0C879 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P0C879 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
P0C879 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P0C879 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P0C879 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P0C879 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P0C879 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P0C879 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
P0C879 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P0C879 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P0C879 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P0C879 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P0C879 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
P0C879 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P0C879 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P0C879 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P0C879 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P0C879 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P0C879 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P0C879 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P0C879 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms