Protein–RNA interactions for Protein: P0C091

FREM3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM3P0C091 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FREM3P0C091 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FREM3P0C091 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FREM3P0C091 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FREM3P0C091 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FREM3P0C091 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FREM3P0C091 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FREM3P0C091 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FREM3P0C091 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FREM3P0C091 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FREM3P0C091 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FREM3P0C091 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FREM3P0C091 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FREM3P0C091 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FREM3P0C091 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FREM3P0C091 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FREM3P0C091 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FREM3P0C091 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FREM3P0C091 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FREM3P0C091 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FREM3P0C091 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FREM3P0C091 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FREM3P0C091 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FREM3P0C091 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FREM3P0C091 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FREM3P0C091 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FREM3P0C091 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FREM3P0C091 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FREM3P0C091 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FREM3P0C091 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FREM3P0C091 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FREM3P0C091 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FREM3P0C091 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FREM3P0C091 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FREM3P0C091 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FREM3P0C091 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FREM3P0C091 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FREM3P0C091 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FREM3P0C091 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FREM3P0C091 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FREM3P0C091 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FREM3P0C091 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FREM3P0C091 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FREM3P0C091 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FREM3P0C091 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FREM3P0C091 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FREM3P0C091 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FREM3P0C091 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FREM3P0C091 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FREM3P0C091 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FREM3P0C091 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FREM3P0C091 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FREM3P0C091 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FREM3P0C091 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FREM3P0C091 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FREM3P0C091 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FREM3P0C091 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FREM3P0C091 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FREM3P0C091 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FREM3P0C091 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FREM3P0C091 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FREM3P0C091 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FREM3P0C091 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FREM3P0C091 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FREM3P0C091 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FREM3P0C091 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FREM3P0C091 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FREM3P0C091 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FREM3P0C091 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FREM3P0C091 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FREM3P0C091 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FREM3P0C091 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FREM3P0C091 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FREM3P0C091 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FREM3P0C091 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FREM3P0C091 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FREM3P0C091 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FREM3P0C091 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FREM3P0C091 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FREM3P0C091 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FREM3P0C091 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FREM3P0C091 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FREM3P0C091 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FREM3P0C091 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FREM3P0C091 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FREM3P0C091 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FREM3P0C091 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FREM3P0C091 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FREM3P0C091 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FREM3P0C091 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FREM3P0C091 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FREM3P0C091 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FREM3P0C091 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FREM3P0C091 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FREM3P0C091 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FREM3P0C091 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FREM3P0C091 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FREM3P0C091 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FREM3P0C091 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FREM3P0C091 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms