Protein–RNA interactions for Protein: P09669

COX6C, Cytochrome c oxidase subunit 6C, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6CP09669 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COX6CP09669 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COX6CP09669 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COX6CP09669 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COX6CP09669 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COX6CP09669 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX6CP09669 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX6CP09669 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX6CP09669 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX6CP09669 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX6CP09669 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX6CP09669 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COX6CP09669 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COX6CP09669 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX6CP09669 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX6CP09669 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX6CP09669 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX6CP09669 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX6CP09669 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX6CP09669 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX6CP09669 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX6CP09669 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX6CP09669 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX6CP09669 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX6CP09669 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX6CP09669 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COX6CP09669 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX6CP09669 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX6CP09669 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6CP09669 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6CP09669 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COX6CP09669 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COX6CP09669 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COX6CP09669 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COX6CP09669 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COX6CP09669 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COX6CP09669 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6CP09669 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6CP09669 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6CP09669 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6CP09669 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6CP09669 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6CP09669 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX6CP09669 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX6CP09669 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6CP09669 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6CP09669 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6CP09669 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6CP09669 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX6CP09669 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX6CP09669 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX6CP09669 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX6CP09669 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX6CP09669 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COX6CP09669 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COX6CP09669 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COX6CP09669 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COX6CP09669 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COX6CP09669 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COX6CP09669 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COX6CP09669 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COX6CP09669 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COX6CP09669 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COX6CP09669 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COX6CP09669 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COX6CP09669 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COX6CP09669 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COX6CP09669 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COX6CP09669 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COX6CP09669 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX6CP09669 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX6CP09669 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX6CP09669 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX6CP09669 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX6CP09669 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX6CP09669 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX6CP09669 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6CP09669 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6CP09669 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6CP09669 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6CP09669 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6CP09669 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6CP09669 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6CP09669 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6CP09669 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX6CP09669 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COX6CP09669 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COX6CP09669 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COX6CP09669 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COX6CP09669 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COX6CP09669 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX6CP09669 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX6CP09669 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX6CP09669 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX6CP09669 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX6CP09669 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COX6CP09669 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COX6CP09669 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COX6CP09669 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COX6CP09669 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms