Protein–RNA interactions for Protein: P08579

SNRPB2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPB2P08579 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNRPB2P08579 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNRPB2P08579 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNRPB2P08579 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNRPB2P08579 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNRPB2P08579 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNRPB2P08579 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNRPB2P08579 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNRPB2P08579 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNRPB2P08579 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNRPB2P08579 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNRPB2P08579 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNRPB2P08579 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNRPB2P08579 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNRPB2P08579 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNRPB2P08579 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNRPB2P08579 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNRPB2P08579 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNRPB2P08579 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNRPB2P08579 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNRPB2P08579 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNRPB2P08579 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNRPB2P08579 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SNRPB2P08579 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNRPB2P08579 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNRPB2P08579 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNRPB2P08579 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNRPB2P08579 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNRPB2P08579 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNRPB2P08579 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNRPB2P08579 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNRPB2P08579 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNRPB2P08579 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNRPB2P08579 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNRPB2P08579 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNRPB2P08579 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNRPB2P08579 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNRPB2P08579 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SNRPB2P08579 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNRPB2P08579 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNRPB2P08579 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNRPB2P08579 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SNRPB2P08579 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNRPB2P08579 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNRPB2P08579 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRPB2P08579 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRPB2P08579 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRPB2P08579 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNRPB2P08579 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNRPB2P08579 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNRPB2P08579 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNRPB2P08579 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNRPB2P08579 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRPB2P08579 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRPB2P08579 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRPB2P08579 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRPB2P08579 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRPB2P08579 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRPB2P08579 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRPB2P08579 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRPB2P08579 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRPB2P08579 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRPB2P08579 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRPB2P08579 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRPB2P08579 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRPB2P08579 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNRPB2P08579 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNRPB2P08579 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRPB2P08579 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRPB2P08579 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRPB2P08579 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRPB2P08579 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRPB2P08579 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRPB2P08579 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRPB2P08579 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNRPB2P08579 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SNRPB2P08579 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SNRPB2P08579 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNRPB2P08579 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNRPB2P08579 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRPB2P08579 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRPB2P08579 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRPB2P08579 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRPB2P08579 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNRPB2P08579 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNRPB2P08579 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNRPB2P08579 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRPB2P08579 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRPB2P08579 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRPB2P08579 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNRPB2P08579 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNRPB2P08579 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNRPB2P08579 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNRPB2P08579 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNRPB2P08579 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNRPB2P08579 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNRPB2P08579 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNRPB2P08579 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNRPB2P08579 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNRPB2P08579 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms