Protein–RNA interactions for Protein: P08237

PFKM, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKMP08237 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PFKMP08237 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PFKMP08237 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PFKMP08237 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PFKMP08237 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PFKMP08237 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PFKMP08237 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PFKMP08237 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PFKMP08237 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PFKMP08237 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PFKMP08237 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PFKMP08237 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PFKMP08237 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PFKMP08237 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PFKMP08237 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PFKMP08237 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PFKMP08237 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PFKMP08237 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PFKMP08237 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PFKMP08237 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PFKMP08237 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PFKMP08237 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PFKMP08237 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PFKMP08237 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PFKMP08237 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PFKMP08237 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PFKMP08237 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PFKMP08237 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PFKMP08237 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PFKMP08237 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PFKMP08237 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PFKMP08237 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PFKMP08237 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PFKMP08237 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PFKMP08237 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PFKMP08237 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PFKMP08237 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PFKMP08237 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PFKMP08237 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PFKMP08237 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PFKMP08237 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PFKMP08237 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PFKMP08237 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PFKMP08237 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PFKMP08237 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PFKMP08237 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PFKMP08237 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PFKMP08237 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PFKMP08237 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PFKMP08237 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PFKMP08237 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PFKMP08237 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PFKMP08237 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PFKMP08237 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PFKMP08237 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PFKMP08237 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PFKMP08237 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PFKMP08237 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PFKMP08237 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PFKMP08237 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PFKMP08237 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PFKMP08237 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PFKMP08237 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PFKMP08237 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PFKMP08237 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PFKMP08237 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PFKMP08237 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PFKMP08237 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PFKMP08237 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PFKMP08237 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PFKMP08237 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PFKMP08237 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PFKMP08237 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PFKMP08237 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PFKMP08237 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PFKMP08237 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PFKMP08237 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PFKMP08237 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PFKMP08237 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PFKMP08237 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PFKMP08237 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PFKMP08237 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PFKMP08237 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PFKMP08237 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PFKMP08237 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PFKMP08237 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PFKMP08237 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PFKMP08237 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PFKMP08237 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PFKMP08237 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PFKMP08237 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PFKMP08237 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PFKMP08237 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PFKMP08237 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PFKMP08237 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PFKMP08237 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PFKMP08237 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PFKMP08237 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PFKMP08237 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PFKMP08237 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms