Protein–RNA interactions for Protein: P07202

TPO, Thyroid peroxidase, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPOP07202 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPOP07202 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPOP07202 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPOP07202 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPOP07202 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPOP07202 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPOP07202 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPOP07202 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPOP07202 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPOP07202 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPOP07202 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPOP07202 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPOP07202 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPOP07202 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPOP07202 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TPOP07202 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPOP07202 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPOP07202 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPOP07202 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPOP07202 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPOP07202 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPOP07202 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPOP07202 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPOP07202 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPOP07202 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TPOP07202 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPOP07202 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPOP07202 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TPOP07202 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPOP07202 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPOP07202 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPOP07202 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TPOP07202 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPOP07202 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPOP07202 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
TPOP07202 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPOP07202 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPOP07202 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPOP07202 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPOP07202 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPOP07202 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TPOP07202 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPOP07202 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TPOP07202 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPOP07202 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPOP07202 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPOP07202 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPOP07202 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPOP07202 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPOP07202 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPOP07202 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPOP07202 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPOP07202 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPOP07202 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPOP07202 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPOP07202 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPOP07202 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPOP07202 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPOP07202 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TPOP07202 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPOP07202 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPOP07202 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPOP07202 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPOP07202 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TPOP07202 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPOP07202 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPOP07202 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPOP07202 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPOP07202 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPOP07202 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPOP07202 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TPOP07202 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPOP07202 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPOP07202 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPOP07202 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPOP07202 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPOP07202 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPOP07202 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPOP07202 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPOP07202 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPOP07202 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPOP07202 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPOP07202 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPOP07202 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPOP07202 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPOP07202 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPOP07202 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPOP07202 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPOP07202 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPOP07202 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPOP07202 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPOP07202 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPOP07202 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPOP07202 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPOP07202 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPOP07202 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPOP07202 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPOP07202 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPOP07202 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPOP07202 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms