Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP1A1P05023 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP1A1P05023 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP1A1P05023 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP1A1P05023 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP1A1P05023 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP1A1P05023 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP1A1P05023 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP1A1P05023 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATP1A1P05023 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATP1A1P05023 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP1A1P05023 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP1A1P05023 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP1A1P05023 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP1A1P05023 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP1A1P05023 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP1A1P05023 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP1A1P05023 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP1A1P05023 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP1A1P05023 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP1A1P05023 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP1A1P05023 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP1A1P05023 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP1A1P05023 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP1A1P05023 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP1A1P05023 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ATP1A1P05023 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP1A1P05023 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP1A1P05023 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP1A1P05023 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP1A1P05023 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP1A1P05023 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP1A1P05023 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP1A1P05023 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP1A1P05023 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP1A1P05023 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP1A1P05023 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP1A1P05023 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP1A1P05023 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP1A1P05023 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP1A1P05023 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP1A1P05023 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP1A1P05023 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP1A1P05023 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP1A1P05023 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP1A1P05023 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP1A1P05023 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP1A1P05023 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP1A1P05023 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP1A1P05023 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP1A1P05023 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP1A1P05023 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP1A1P05023 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP1A1P05023 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATP1A1P05023 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP1A1P05023 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP1A1P05023 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP1A1P05023 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP1A1P05023 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP1A1P05023 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP1A1P05023 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP1A1P05023 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP1A1P05023 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP1A1P05023 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP1A1P05023 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP1A1P05023 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP1A1P05023 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP1A1P05023 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP1A1P05023 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP1A1P05023 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP1A1P05023 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP1A1P05023 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP1A1P05023 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP1A1P05023 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP1A1P05023 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP1A1P05023 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP1A1P05023 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP1A1P05023 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP1A1P05023 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP1A1P05023 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP1A1P05023 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP1A1P05023 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP1A1P05023 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP1A1P05023 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP1A1P05023 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP1A1P05023 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP1A1P05023 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP1A1P05023 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP1A1P05023 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP1A1P05023 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP1A1P05023 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP1A1P05023 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP1A1P05023 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP1A1P05023 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP1A1P05023 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP1A1P05023 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP1A1P05023 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP1A1P05023 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP1A1P05023 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP1A1P05023 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms