Protein–RNA interactions for Protein: P04424

ASL, Argininosuccinate lyase, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASLP04424 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ASLP04424 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ASLP04424 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ASLP04424 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ASLP04424 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ASLP04424 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ASLP04424 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ASLP04424 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ASLP04424 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ASLP04424 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ASLP04424 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ASLP04424 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ASLP04424 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ASLP04424 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ASLP04424 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ASLP04424 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ASLP04424 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ASLP04424 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ASLP04424 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ASLP04424 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ASLP04424 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ASLP04424 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ASLP04424 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ASLP04424 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ASLP04424 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ASLP04424 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ASLP04424 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ASLP04424 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ASLP04424 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ASLP04424 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ASLP04424 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ASLP04424 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ASLP04424 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ASLP04424 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ASLP04424 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ASLP04424 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ASLP04424 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ASLP04424 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ASLP04424 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ASLP04424 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ASLP04424 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ASLP04424 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ASLP04424 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ASLP04424 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ASLP04424 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ASLP04424 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ASLP04424 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ASLP04424 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ASLP04424 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ASLP04424 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ASLP04424 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ASLP04424 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ASLP04424 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
ASLP04424 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ASLP04424 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
ASLP04424 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ASLP04424 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ASLP04424 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ASLP04424 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ASLP04424 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ASLP04424 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ASLP04424 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ASLP04424 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ASLP04424 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ASLP04424 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ASLP04424 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ASLP04424 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ASLP04424 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ASLP04424 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ASLP04424 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ASLP04424 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ASLP04424 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ASLP04424 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ASLP04424 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ASLP04424 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ASLP04424 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ASLP04424 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ASLP04424 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ASLP04424 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ASLP04424 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ASLP04424 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ASLP04424 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ASLP04424 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ASLP04424 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ASLP04424 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ASLP04424 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ASLP04424 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ASLP04424 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ASLP04424 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ASLP04424 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ASLP04424 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ASLP04424 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ASLP04424 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ASLP04424 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ASLP04424 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ASLP04424 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ASLP04424 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ASLP04424 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ASLP04424 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ASLP04424 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms