Protein–RNA interactions for Protein: P04180

LCAT, Phosphatidylcholine-sterol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCATP04180 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCATP04180 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCATP04180 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCATP04180 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCATP04180 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCATP04180 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCATP04180 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCATP04180 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCATP04180 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCATP04180 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCATP04180 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCATP04180 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCATP04180 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCATP04180 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCATP04180 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCATP04180 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCATP04180 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCATP04180 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCATP04180 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCATP04180 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCATP04180 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCATP04180 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCATP04180 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCATP04180 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCATP04180 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCATP04180 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCATP04180 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCATP04180 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCATP04180 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LCATP04180 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCATP04180 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCATP04180 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCATP04180 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCATP04180 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LCATP04180 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCATP04180 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCATP04180 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCATP04180 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCATP04180 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCATP04180 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCATP04180 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCATP04180 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCATP04180 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCATP04180 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LCATP04180 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCATP04180 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCATP04180 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCATP04180 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCATP04180 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCATP04180 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LCATP04180 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCATP04180 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCATP04180 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCATP04180 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LCATP04180 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCATP04180 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCATP04180 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCATP04180 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCATP04180 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCATP04180 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCATP04180 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCATP04180 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCATP04180 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCATP04180 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCATP04180 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCATP04180 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCATP04180 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCATP04180 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCATP04180 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCATP04180 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCATP04180 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCATP04180 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCATP04180 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCATP04180 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCATP04180 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCATP04180 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCATP04180 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCATP04180 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCATP04180 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCATP04180 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCATP04180 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCATP04180 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCATP04180 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCATP04180 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCATP04180 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCATP04180 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LCATP04180 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCATP04180 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCATP04180 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCATP04180 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCATP04180 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCATP04180 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCATP04180 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LCATP04180 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCATP04180 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCATP04180 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCATP04180 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCATP04180 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCATP04180 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCATP04180 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms