Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFNB1P01574 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFNB1P01574 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IFNB1P01574 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IFNB1P01574 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFNB1P01574 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFNB1P01574 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFNB1P01574 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFNB1P01574 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFNB1P01574 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFNB1P01574 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFNB1P01574 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFNB1P01574 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IFNB1P01574 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFNB1P01574 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFNB1P01574 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFNB1P01574 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFNB1P01574 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFNB1P01574 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFNB1P01574 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFNB1P01574 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFNB1P01574 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFNB1P01574 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFNB1P01574 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFNB1P01574 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFNB1P01574 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFNB1P01574 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFNB1P01574 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFNB1P01574 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFNB1P01574 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFNB1P01574 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFNB1P01574 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFNB1P01574 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFNB1P01574 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFNB1P01574 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFNB1P01574 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFNB1P01574 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFNB1P01574 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFNB1P01574 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFNB1P01574 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFNB1P01574 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
IFNB1P01574 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFNB1P01574 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFNB1P01574 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFNB1P01574 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFNB1P01574 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFNB1P01574 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFNB1P01574 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFNB1P01574 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFNB1P01574 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFNB1P01574 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFNB1P01574 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFNB1P01574 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFNB1P01574 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFNB1P01574 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFNB1P01574 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFNB1P01574 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFNB1P01574 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFNB1P01574 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFNB1P01574 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFNB1P01574 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
IFNB1P01574 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFNB1P01574 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFNB1P01574 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFNB1P01574 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFNB1P01574 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFNB1P01574 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
IFNB1P01574 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFNB1P01574 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFNB1P01574 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFNB1P01574 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFNB1P01574 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFNB1P01574 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFNB1P01574 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFNB1P01574 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFNB1P01574 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFNB1P01574 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFNB1P01574 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFNB1P01574 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFNB1P01574 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
IFNB1P01574 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFNB1P01574 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFNB1P01574 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFNB1P01574 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFNB1P01574 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFNB1P01574 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFNB1P01574 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFNB1P01574 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFNB1P01574 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IFNB1P01574 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFNB1P01574 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IFNB1P01574 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFNB1P01574 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IFNB1P01574 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFNB1P01574 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFNB1P01574 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFNB1P01574 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFNB1P01574 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFNB1P01574 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFNB1P01574 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms